More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0965 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  39.19 
 
 		 1011 aa  704    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.53 
 
 		 1049 aa  765    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1024 aa  2052    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  37.65 
 
 		 1050 aa  686    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  37.66 
 
 		 1043 aa  642    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  36.28 
 
 		 1034 aa  657    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  35.87 
 
 		 1043 aa  622  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  35.1 
 
 		 1039 aa  614  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 		 1058 aa  610  1e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 		 1044 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  34.57 
 
 		 1055 aa  607  9.999999999999999e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  35.97 
 
 		 1040 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  35.15 
 
 		 1044 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1063 aa  602  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  33.92 
 
 		 1046 aa  588  1e-166  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  32.33 
 
 		 1053 aa  587  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 		 1038 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  36.52 
 
 		 1027 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  33.36 
 
 		 1069 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  34.27 
 
 		 1040 aa  582  1.0000000000000001e-165  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1059 aa  582  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  32.86 
 
 		 1070 aa  581  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  34.32 
 
 		 1028 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  33.75 
 
 		 1034 aa  576  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  32.23 
 
 		 1058 aa  572  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1039 aa  576  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  33.93 
 
 		 1028 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  33.62 
 
 		 1050 aa  572  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1055 aa  567  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  31.62 
 
 		 1095 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  34.34 
 
 		 1017 aa  566  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  32.15 
 
 		 1034 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  32.54 
 
 		 1075 aa  561  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1041 aa  562  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1470 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  32.89 
 
 		 1058 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  32.23 
 
 		 1032 aa  555  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1067 aa  555  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  31.36 
 
 		 1036 aa  543  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  34.7 
 
 		 1026 aa  545  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 		 1054 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  30.92 
 
 		 1071 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1041 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 		 1054 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  34.02 
 
 		 1028 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 		 1054 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  30.52 
 
 		 1048 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  35 
 
 		 1028 aa  536  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  31.56 
 
 		 1496 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  34.91 
 
 		 1027 aa  533  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  32.58 
 
 		 1028 aa  535  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1050 aa  531  1e-149  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  32.21 
 
 		 1023 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  32.01 
 
 		 1036 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 		 1049 aa  529  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.03 
 
 		 1081 aa  531  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  32.66 
 
 		 1044 aa  528  1e-148  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1066 aa  527  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 		 1062 aa  526  1e-148  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1046 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 		 1038 aa  522  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1082 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1024 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  31.5 
 
 		 1047 aa  508  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.9 
 
 		 1024 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 		 1065 aa  506  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 		 1031 aa  500  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  30.88 
 
 		 1041 aa  501  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 		 1027 aa  500  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1051 aa  496  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  31.12 
 
 		 1173 aa  497  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  29.96 
 
 		 1073 aa  496  1e-139  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 		 1036 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1087 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1087 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1048 aa  495  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  31.68 
 
 		 1102 aa  492  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.67 
 
 		 1091 aa  490  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  31.45 
 
 		 1083 aa  491  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1085 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1087 aa  491  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1038 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1085 aa  489  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  30.77 
 
 		 1035 aa  489  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1085 aa  489  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1085 aa  489  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1033 aa  489  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 		 1045 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  29.13 
 
 		 1006 aa  483  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1030 aa  481  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 		 1044 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 		 1031 aa  478  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1029 aa  474  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  31.37 
 
 		 1022 aa  473  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1083 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1042 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  30.12 
 
 		 1034 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1022 aa  473  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 		 1033 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1092 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>