More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3831 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3831  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1024 aa  2053    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2346  acriflavin resistance protein  99.9 
 
 		 1024 aa  2053    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.322733  hitchhiker  0.00300678 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1043 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1087 aa  494  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  29.2 
 
 		 1034 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 		 1043 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 		 1057 aa  485  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  30.33 
 
 		 1011 aa  481  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1069 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 		 1070 aa  459  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 		 1034 aa  449  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3520  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1061 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2586  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1061 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 		 1040 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.33 
 
 		 1050 aa  444  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1044 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.72 
 
 		 1049 aa  432  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.61 
 
 		 1046 aa  431  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2979  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1079 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1053 aa  428  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1055 aa  429  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1044 aa  425  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1869  cation efflux system protein  30.27 
 
 		 1084 aa  421  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.443113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.4 
 
 		 1024 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1006 aa  415  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1048 aa  410  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 		 1028 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1038 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1173 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1017 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.4 
 
 		 1024 aa  403  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  29.88 
 
 		 1028 aa  401  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1039 aa  402  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 		 1026 aa  402  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1085 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 		 1085 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 		 1085 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 		 1085 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.28 
 
 		 1091 aa  396  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 		 1038 aa  396  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 		 1047 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  28.41 
 
 		 1064 aa  395  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1087 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  27.89 
 
 		 1087 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  27.89 
 
 		 1087 aa  391  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1083 aa  389  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  28.23 
 
 		 1050 aa  389  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.16 
 
 		 1470 aa  389  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2319  RND efflux transporter  29.5 
 
 		 1023 aa  385  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  29.99 
 
 		 1027 aa  386  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1073 aa  384  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1023 aa  386  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  27.37 
 
 		 1044 aa  384  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.12 
 
 		 1122 aa  384  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1024 aa  381  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1071 aa  383  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  27.71 
 
 		 1051 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1041 aa  378  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1022 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 		 1028 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  26.34 
 
 		 1050 aa  378  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  26.59 
 
 		 1031 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.61 
 
 		 1065 aa  376  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.43 
 
 		 1036 aa  376  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  29.08 
 
 		 1028 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  27.04 
 
 		 1029 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2330  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 		 1032 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.290618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  28.93 
 
 		 1027 aa  375  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 		 1026 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2801  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 		 1032 aa  373  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0747979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2187  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1032 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.89 
 
 		 1032 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1035 aa  369  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  26.55 
 
 		 1041 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1036 aa  365  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2522  acriflavin resistance protein  27.46 
 
 		 1034 aa  365  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.984252  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  28.74 
 
 		 1029 aa  364  4e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2704  multidrug efflux system subunit MdtC  26.94 
 
 		 1030 aa  364  5.0000000000000005e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31890  putative RND efflux transporter  28.74 
 
 		 1043 aa  364  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0910827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  27.84 
 
 		 1023 aa  363  9e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  25.76 
 
 		 1051 aa  362  2e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5557  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28 
 
 		 1032 aa  362  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130118  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1168  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 		 1038 aa  362  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  26.08 
 
 		 1068 aa  362  2e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  27 
 
 		 1032 aa  362  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  28.7 
 
 		 1040 aa  362  3e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  25.71 
 
 		 1069 aa  361  3e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  25.54 
 
 		 1059 aa  360  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 		 1070 aa  359  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2709  RND efflux transporter  28.64 
 
 		 1043 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.1 
 
 		 1034 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1048 aa  358  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  26.23 
 
 		 1046 aa  358  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1043 aa  357  5e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  26.18 
 
 		 1496 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1058 aa  357  5.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1039 aa  357  6.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 		 1083 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2430  acriflavin resistance protein  27.37 
 
 		 1030 aa  357  8.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157087  normal  0.957896 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 		 1037 aa  357  8.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>