More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2317 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1029 aa  2014    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0304  acriflavin resistance protein  72.69 
 
 
1028 aa  1392    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.99394  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  44.23 
 
 
1051 aa  831    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 
1034 aa  527  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1132  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 
1034 aa  508  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0572  acriflavin resistance protein  31.11 
 
 
1033 aa  497  1e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000015454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0522  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 
1032 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.302221 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 
1071 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 
1050 aa  488  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.76 
 
 
1055 aa  477  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  30.26 
 
 
1058 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 
1011 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  31.21 
 
 
1496 aa  464  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  30.8 
 
 
1023 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  34.08 
 
 
1043 aa  462  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 
1095 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 
1053 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  29.32 
 
 
1043 aa  459  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  31.1 
 
 
1069 aa  457  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  33.13 
 
 
1017 aa  459  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.15 
 
 
1024 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 
1032 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  31.45 
 
 
1470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 
1024 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 
1027 aa  453  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  30.87 
 
 
1083 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  30.8 
 
 
1075 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 
1048 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 
1058 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  30.31 
 
 
1038 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 
1046 aa  449  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  30.3 
 
 
1034 aa  445  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  31.96 
 
 
1039 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  29.12 
 
 
1065 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  31.36 
 
 
1036 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  29.33 
 
 
1044 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 
1034 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 
1036 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 
1070 aa  441  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  32.67 
 
 
1031 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  32.65 
 
 
1044 aa  438  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 
1022 aa  435  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 
1041 aa  433  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 
1036 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 
1048 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 
1044 aa  432  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  30.53 
 
 
1041 aa  432  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 
1054 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  31.04 
 
 
1066 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  32.26 
 
 
1054 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 
1054 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.99 
 
 
1024 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  28 
 
 
1058 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 
1082 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  27.83 
 
 
1039 aa  426  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  28.12 
 
 
1050 aa  429  1e-118  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  32.47 
 
 
1027 aa  425  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  30.73 
 
 
1046 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  29.32 
 
 
1063 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  32.54 
 
 
1031 aa  426  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  30.68 
 
 
1027 aa  426  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 
1045 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  32.54 
 
 
1031 aa  426  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 
1067 aa  423  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 
1038 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 
1040 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 
1026 aa  420  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 
1033 aa  422  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 
1059 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  31.97 
 
 
1405 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 
1033 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 
1033 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 
1085 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 
1087 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 
1087 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  32.8 
 
 
1028 aa  418  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  30.34 
 
 
1087 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 
1031 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  25.88 
 
 
1038 aa  418  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 
1049 aa  413  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  29.28 
 
 
1044 aa  415  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  32.64 
 
 
1028 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  32.73 
 
 
1044 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  29.94 
 
 
1087 aa  416  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  30.26 
 
 
1095 aa  415  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  32.5 
 
 
1028 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  32.51 
 
 
1028 aa  412  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  29.11 
 
 
1030 aa  411  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  32.47 
 
 
1025 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.44 
 
 
1091 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  28.87 
 
 
1050 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  31.85 
 
 
1035 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  29.48 
 
 
1083 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 
1173 aa  408  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  32.24 
 
 
1028 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 
1051 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  28.26 
 
 
1040 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 
1006 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  32.57 
 
 
1038 aa  409  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 
1031 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>