More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6179 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  41.98 
 
 		 1496 aa  810    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  49.29 
 
 		 1071 aa  976    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  41.03 
 
 		 1038 aa  759    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  41.84 
 
 		 1032 aa  818    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  41.77 
 
 		 1041 aa  786    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  39 
 
 		 1054 aa  710    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  40.37 
 
 		 1067 aa  714    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  44.78 
 
 		 1075 aa  870    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1065 aa  2125    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  44.68 
 
 		 1066 aa  863    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  41.79 
 
 		 1470 aa  792    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  44.93 
 
 		 1095 aa  915    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  37.97 
 
 		 1028 aa  636    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  39.29 
 
 		 1054 aa  718    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  46.23 
 
 		 1069 aa  920    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  39.76 
 
 		 1055 aa  653    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  39.19 
 
 		 1054 aa  716    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  44.74 
 
 		 1039 aa  816    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  54.12 
 
 		 1033 aa  1045    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  40.87 
 
 		 1036 aa  786    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  45.39 
 
 		 1070 aa  920    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  37.75 
 
 		 1028 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  38.1 
 
 		 1028 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  35.02 
 
 		 1050 aa  608  9.999999999999999e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  32.79 
 
 		 1058 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  32.37 
 
 		 1034 aa  581  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  37.45 
 
 		 1028 aa  572  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1062 aa  566  1e-160  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  34.79 
 
 		 1035 aa  560  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 		 1034 aa  557  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  37.22 
 
 		 1045 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  37.31 
 
 		 1038 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  33.91 
 
 		 1032 aa  547  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 		 1009 aa  549  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 		 1044 aa  548  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 		 1039 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 		 1036 aa  544  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  33.6 
 
 		 1033 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  33.6 
 
 		 1033 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.31 
 
 		 1024 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 		 1053 aa  542  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  33.52 
 
 		 1036 aa  542  9.999999999999999e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 		 1031 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1044 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1011 aa  536  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  33.65 
 
 		 1043 aa  536  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  33.81 
 
 		 1027 aa  536  1e-151  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  37.22 
 
 		 1044 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 		 1058 aa  538  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1044 aa  536  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  34.55 
 
 		 1031 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  33.3 
 
 		 1405 aa  535  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  31.83 
 
 		 1058 aa  533  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  34.64 
 
 		 1031 aa  535  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  34.39 
 
 		 1027 aa  532  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1034 aa  530  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  33.85 
 
 		 1026 aa  529  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  32.11 
 
 		 1022 aa  528  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  34.57 
 
 		 1047 aa  528  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1031 aa  527  1e-148  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1048 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 		 1043 aa  525  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1063 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  33.75 
 
 		 1028 aa  521  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1029 aa  520  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1050 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  32.36 
 
 		 1035 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  31.29 
 
 		 1050 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4664  acriflavin resistance protein  34.66 
 
 		 1025 aa  518  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3464  Acr family transporter  32.35 
 
 		 1101 aa  514  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  32.56 
 
 		 1040 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  32.92 
 
 		 1031 aa  514  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 		 1040 aa  514  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  32.31 
 
 		 1041 aa  514  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 		 1041 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  30.74 
 
 		 1059 aa  515  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2622  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1014 aa  512  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  32.51 
 
 		 1018 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  31.34 
 
 		 1035 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  32.87 
 
 		 1088 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  32.65 
 
 		 1088 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1515  acriflavin resistance protein  32.5 
 
 		 1038 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1048 aa  506  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 		 1033 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  31.83 
 
 		 1055 aa  507  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 		 1023 aa  508  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0557  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  31.43 
 
 		 1046 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644093  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  32.44 
 
 		 1088 aa  505  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1042 aa  504  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  30.97 
 
 		 1036 aa  504  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  32.34 
 
 		 1043 aa  504  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 		 1060 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  31.9 
 
 		 1044 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  31.37 
 
 		 1058 aa  506  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5613  acriflavin resistance protein  32.79 
 
 		 1050 aa  505  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1064 aa  503  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.38 
 
 		 1031 aa  502  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1031 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  32.25 
 
 		 1048 aa  499  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1040 aa  501  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>