More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0608 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  63.82 
 
 		 1058 aa  1349    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  47.39 
 
 		 1053 aa  995    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  65.48 
 
 		 1063 aa  1406    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  45.5 
 
 		 1036 aa  914    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  56.74 
 
 		 1058 aa  1175    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  47.48 
 
 		 1039 aa  951    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  46.56 
 
 		 1050 aa  918    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  45.21 
 
 		 1055 aa  890    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  47.28 
 
 		 1046 aa  906    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  47.92 
 
 		 1041 aa  949    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  49.55 
 
 		 1049 aa  961    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  46.78 
 
 		 1048 aa  932    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  49.62 
 
 		 1040 aa  968    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  48.15 
 
 		 1034 aa  968    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1059 aa  2129    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  35.94 
 
 		 1058 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  34.37 
 
 		 1038 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1043 aa  579  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1050 aa  576  1.0000000000000001e-163  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.91 
 
 		 1024 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  33.5 
 
 		 1028 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1034 aa  570  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  32.47 
 
 		 1039 aa  569  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1028 aa  569  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  32.04 
 
 		 1011 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  32.22 
 
 		 1043 aa  561  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 		 1055 aa  555  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  32.76 
 
 		 1028 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  31.34 
 
 		 1069 aa  547  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  32.53 
 
 		 1496 aa  542  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1095 aa  538  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1071 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  30.74 
 
 		 1065 aa  528  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1470 aa  525  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1036 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 		 1044 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  30.02 
 
 		 1070 aa  516  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1032 aa  514  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1045 aa  515  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1028 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1044 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 		 1062 aa  507  9.999999999999999e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1044 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1041 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 		 1038 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 		 1066 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 		 1075 aa  501  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 		 1047 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1046 aa  499  1e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 		 1023 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  31.56 
 
 		 1028 aa  492  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1054 aa  492  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  31.03 
 
 		 1031 aa  490  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1054 aa  492  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.6 
 
 		 1049 aa  487  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 		 1101 aa  488  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1022 aa  487  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 		 1031 aa  487  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 		 1054 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 		 1009 aa  485  1e-135  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1034 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 		 1033 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 		 1035 aa  481  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1073 aa  482  1e-134  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  29.99 
 
 		 1031 aa  482  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  29.36 
 
 		 1026 aa  480  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1067 aa  482  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.28 
 
 		 1024 aa  479  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 		 1044 aa  479  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  31.53 
 
 		 1048 aa  477  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  28.93 
 
 		 1027 aa  476  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 		 1046 aa  475  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  30.55 
 
 		 1051 aa  473  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1026 aa  475  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  29.98 
 
 		 1040 aa  473  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  30.53 
 
 		 1027 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  29.96 
 
 		 1028 aa  473  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1006 aa  468  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 		 1040 aa  468  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  30.48 
 
 		 1013 aa  460  9.999999999999999e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  29.9 
 
 		 1060 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  29.18 
 
 		 1032 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 		 1023 aa  461  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  30.92 
 
 		 1024 aa  458  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  29.74 
 
 		 1042 aa  459  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1058 aa  459  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1040 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  30.19 
 
 		 1026 aa  458  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1043 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  29.89 
 
 		 1042 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 		 1022 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1064 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 		 1044 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  28.91 
 
 		 1036 aa  451  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 		 1027 aa  452  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 		 1044 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1037 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  28.87 
 
 		 1031 aa  451  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1038 aa  452  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.45 
 
 		 1017 aa  450  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>