More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1025 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  39.61 
 
 
1011 aa  698    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  62.35 
 
 
1044 aa  1327    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  69.22 
 
 
1046 aa  1509    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1050 aa  2110    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  53.74 
 
 
1038 aa  1138    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  37.99 
 
 
1044 aa  665    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  37.05 
 
 
1043 aa  662    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  36.03 
 
 
1034 aa  627  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  36.66 
 
 
1044 aa  623  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  36.36 
 
 
1050 aa  621  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  36.32 
 
 
1027 aa  592  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  35.26 
 
 
1034 aa  592  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 
1040 aa  575  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  34.82 
 
 
1043 aa  570  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.08 
 
 
1049 aa  563  1.0000000000000001e-159  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.27 
 
 
1024 aa  558  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 
1083 aa  554  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 
1082 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  34.04 
 
 
1041 aa  539  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  34.04 
 
 
1024 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  31.66 
 
 
1086 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  34.15 
 
 
1026 aa  530  1e-149  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  33.12 
 
 
1087 aa  522  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.72 
 
 
1081 aa  522  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  31.82 
 
 
1017 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  32.87 
 
 
1085 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  34.51 
 
 
1028 aa  513  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 
1038 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33 
 
 
1091 aa  513  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 
1023 aa  513  1e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 
1085 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 
1085 aa  513  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 
1085 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 
1102 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  32.81 
 
 
1083 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  32.72 
 
 
1087 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 
1087 aa  505  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  32.72 
 
 
1087 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  31.66 
 
 
1006 aa  502  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  31 
 
 
1039 aa  499  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 
1058 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 
1055 aa  495  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0140  acriflavine resistance protein  31.52 
 
 
1071 aa  492  1e-137  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  30.05 
 
 
1071 aa  488  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 
1027 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  29.77 
 
 
1069 aa  477  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  30.68 
 
 
1041 aa  478  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  30.68 
 
 
1047 aa  476  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 
1034 aa  479  1e-133  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 
1470 aa  476  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 
1038 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  29.39 
 
 
1045 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  30.41 
 
 
1050 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.59 
 
 
1059 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  29.9 
 
 
1040 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 
1058 aa  465  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  29.16 
 
 
1041 aa  465  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  29.93 
 
 
1039 aa  464  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  29.11 
 
 
1032 aa  466  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 
1044 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 
1063 aa  460  9.999999999999999e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  29.11 
 
 
1070 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  28.19 
 
 
1058 aa  459  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  29.43 
 
 
1046 aa  459  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 
1026 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.84 
 
 
1496 aa  452  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  29.86 
 
 
1049 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 
1095 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  29.7 
 
 
1065 aa  451  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 
1028 aa  452  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  28.47 
 
 
1053 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 
1041 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  29.15 
 
 
1031 aa  444  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  28.53 
 
 
1036 aa  446  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 
1075 aa  443  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  29.62 
 
 
1022 aa  445  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.4 
 
 
1024 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 
1073 aa  442  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  29.39 
 
 
1048 aa  443  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 
1171 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  29.32 
 
 
1028 aa  439  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 
1101 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  28.93 
 
 
1066 aa  439  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  29.76 
 
 
1028 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 
1048 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  29.15 
 
 
1036 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 
1177 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 
1055 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  29.42 
 
 
1068 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1638  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 
1026 aa  429  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.643434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 
1022 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 
1009 aa  425  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  29 
 
 
1074 aa  425  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  27.67 
 
 
1062 aa  424  1e-117  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 
1092 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0306  RND efflux transporter  30.48 
 
 
1044 aa  424  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 
1033 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3831  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 
1024 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  28.01 
 
 
1044 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2346  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 
1024 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.322733  hitchhiker  0.00300678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>