More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0160 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  40.83 
 
 		 1028 aa  675    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  47.05 
 
 		 1075 aa  901    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  42.91 
 
 		 1496 aa  822    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  47.27 
 
 		 1069 aa  931    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  48.71 
 
 		 1071 aa  964    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  43.05 
 
 		 1041 aa  798    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  41.83 
 
 		 1032 aa  831    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  42.05 
 
 		 1067 aa  738    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  41.19 
 
 		 1054 aa  728    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  41.77 
 
 		 1054 aa  728    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  47.05 
 
 		 1066 aa  905    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  41.17 
 
 		 1038 aa  752    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  45.86 
 
 		 1095 aa  929    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  41.61 
 
 		 1036 aa  805    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  41.81 
 
 		 1055 aa  680    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  41.39 
 
 		 1054 aa  731    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  40.93 
 
 		 1028 aa  662    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  44.5 
 
 		 1039 aa  829    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  39.45 
 
 		 1028 aa  660    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  54.17 
 
 		 1065 aa  1090    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1033 aa  2032    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  42.98 
 
 		 1470 aa  811    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  47.09 
 
 		 1070 aa  943    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  40.34 
 
 		 1028 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  34.94 
 
 		 1050 aa  596  1e-169  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  33.81 
 
 		 1062 aa  589  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1055 aa  578  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1044 aa  579  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 		 1034 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  35.36 
 
 		 1026 aa  567  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 		 1011 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.09 
 
 		 1024 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  32.14 
 
 		 1050 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1040 aa  559  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  35.33 
 
 		 1035 aa  561  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  38.56 
 
 		 1045 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  33.81 
 
 		 1044 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  35.19 
 
 		 1031 aa  555  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  34.21 
 
 		 1022 aa  553  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  35.64 
 
 		 1043 aa  553  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1047 aa  550  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  35.11 
 
 		 1044 aa  551  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  32.8 
 
 		 1073 aa  548  1e-154  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  38.45 
 
 		 1038 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  34.05 
 
 		 1009 aa  548  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  35.6 
 
 		 1031 aa  546  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  35.8 
 
 		 1031 aa  549  1e-154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  34.66 
 
 		 1036 aa  545  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  38.48 
 
 		 1044 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1042 aa  542  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  32.7 
 
 		 1058 aa  542  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 		 1053 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  34.46 
 
 		 1018 aa  536  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  33.05 
 
 		 1040 aa  538  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1048 aa  538  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  32.76 
 
 		 1029 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  34.54 
 
 		 1033 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  34.54 
 
 		 1033 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  32.04 
 
 		 1032 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1039 aa  532  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  32.02 
 
 		 1043 aa  528  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  34.11 
 
 		 1031 aa  528  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 		 1034 aa  529  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  34.04 
 
 		 1028 aa  526  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  34.78 
 
 		 1048 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  34.31 
 
 		 1037 aa  525  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1058 aa  525  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  32.28 
 
 		 1051 aa  523  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  32.04 
 
 		 1033 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1027 aa  522  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  32.49 
 
 		 1068 aa  520  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  34.75 
 
 		 1405 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  31.06 
 
 		 1036 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 		 1041 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1040 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  32.41 
 
 		 1055 aa  518  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4664  acriflavin resistance protein  35.95 
 
 		 1025 aa  519  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1058 aa  515  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  32.39 
 
 		 1035 aa  511  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  34.19 
 
 		 1101 aa  512  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1050 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  33.83 
 
 		 1044 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  34.43 
 
 		 1088 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  32.72 
 
 		 1029 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  34.21 
 
 		 1037 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1042 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.14 
 
 		 1024 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1031 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 		 1063 aa  508  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1044 aa  509  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0557  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  33.73 
 
 		 1046 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644093  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1036 aa  507  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  33.58 
 
 		 1083 aa  504  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1060 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  34.21 
 
 		 1039 aa  503  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  32.47 
 
 		 1035 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  32.37 
 
 		 1027 aa  503  1e-141  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  32.72 
 
 		 1041 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 		 1059 aa  506  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4395  acriflavin resistance protein  35.02 
 
 		 1047 aa  500  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.882422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>