More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1268 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  45.36 
 
 		 1039 aa  901    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  45.77 
 
 		 1040 aa  879    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  67.88 
 
 		 1063 aa  1468    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  43.93 
 
 		 1036 aa  869    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  45.37 
 
 		 1041 aa  887    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  42.13 
 
 		 1055 aa  835    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1058 aa  2144    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  46.32 
 
 		 1048 aa  917    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  43.72 
 
 		 1050 aa  860    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  61.57 
 
 		 1058 aa  1320    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  46.57 
 
 		 1049 aa  859    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  46.18 
 
 		 1046 aa  854    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  44.28 
 
 		 1034 aa  908    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  46.5 
 
 		 1053 aa  962    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  63.82 
 
 		 1059 aa  1327    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  34.13 
 
 		 1038 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1050 aa  593  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.62 
 
 		 1024 aa  588  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1011 aa  584  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  34 
 
 		 1043 aa  585  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 		 1034 aa  579  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  32.12 
 
 		 1039 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 		 1043 aa  571  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 		 1058 aa  569  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  32.25 
 
 		 1044 aa  549  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 		 1055 aa  548  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  32.47 
 
 		 1496 aa  539  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  32.65 
 
 		 1028 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  30.81 
 
 		 1069 aa  536  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1032 aa  535  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  31.83 
 
 		 1065 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  32.56 
 
 		 1036 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 		 1041 aa  531  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 		 1028 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  29.93 
 
 		 1095 aa  529  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1470 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  31.41 
 
 		 1071 aa  523  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.5 
 
 		 1049 aa  516  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  31.48 
 
 		 1047 aa  516  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1028 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  32.25 
 
 		 1067 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  30.4 
 
 		 1070 aa  516  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  31.75 
 
 		 1075 aa  513  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 		 1066 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1054 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1054 aa  513  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1054 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  30.99 
 
 		 1046 aa  502  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1045 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  31.09 
 
 		 1044 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1023 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1038 aa  496  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1044 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1034 aa  491  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1027 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 		 1028 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  30.42 
 
 		 1026 aa  483  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1040 aa  485  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1033 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1044 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  30.04 
 
 		 1035 aa  480  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1026 aa  480  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 1028 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 		 1022 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 		 1017 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1042 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 		 1031 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1040 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  29.99 
 
 		 1051 aa  469  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1073 aa  468  9.999999999999999e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  30.36 
 
 		 1040 aa  469  9.999999999999999e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  28.74 
 
 		 1062 aa  465  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1048 aa  463  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 		 1044 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 		 1027 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2967  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1032 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510734  normal  0.0225941 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  29.65 
 
 		 1036 aa  457  1e-127  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  29.04 
 
 		 1037 aa  459  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1009 aa  457  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  29.93 
 
 		 1028 aa  458  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  29.18 
 
 		 1177 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  28.94 
 
 		 1031 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  29.56 
 
 		 1042 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 		 1024 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  28.77 
 
 		 1171 aa  456  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 		 1101 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  30.87 
 
 		 1050 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.02 
 
 		 1024 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1031 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 		 1060 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  29.58 
 
 		 1036 aa  449  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 		 1058 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 		 1044 aa  449  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  28.83 
 
 		 1032 aa  444  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1027 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  29.36 
 
 		 1031 aa  445  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  28.67 
 
 		 1031 aa  445  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1014 aa  442  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  29.38 
 
 		 1006 aa  442  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  28.83 
 
 		 1023 aa  441  9.999999999999999e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>