More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1842 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  45.58 
 
 		 1049 aa  849    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  61.57 
 
 		 1058 aa  1327    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  56.74 
 
 		 1059 aa  1159    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  43.19 
 
 		 1036 aa  835    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  44.56 
 
 		 1041 aa  871    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  45.09 
 
 		 1040 aa  872    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  58.9 
 
 		 1063 aa  1238    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  42.87 
 
 		 1034 aa  852    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  42.3 
 
 		 1050 aa  850    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  41.01 
 
 		 1055 aa  821    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  45.86 
 
 		 1053 aa  931    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  44.22 
 
 		 1046 aa  829    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  44.5 
 
 		 1048 aa  869    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1058 aa  2142    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  44.23 
 
 		 1039 aa  879    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  34.81 
 
 		 1038 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  32.79 
 
 		 1050 aa  605  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  33.02 
 
 		 1058 aa  597  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 		 1034 aa  587  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  32.64 
 
 		 1039 aa  576  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1043 aa  574  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1044 aa  569  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1011 aa  561  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.07 
 
 		 1024 aa  554  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  31.68 
 
 		 1071 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 		 1028 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  32.74 
 
 		 1055 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 		 1065 aa  544  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1043 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1028 aa  542  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  31.14 
 
 		 1069 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1470 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  32.31 
 
 		 1032 aa  535  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  33.11 
 
 		 1496 aa  531  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1041 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  31.56 
 
 		 1044 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  32.83 
 
 		 1036 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.81 
 
 		 1049 aa  518  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1095 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  29.66 
 
 		 1070 aa  518  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  31.7 
 
 		 1066 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1028 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 		 1047 aa  510  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1031 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  30.52 
 
 		 1045 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1075 aa  507  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  31.89 
 
 		 1073 aa  506  1e-141  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  30.33 
 
 		 1023 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1054 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1054 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 		 1044 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 		 1027 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1054 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 		 1028 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  31.22 
 
 		 1067 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1040 aa  494  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1033 aa  495  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 		 1042 aa  492  1e-137  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.25 
 
 		 1024 aa  488  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 		 1027 aa  486  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 		 1060 aa  489  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1040 aa  488  1e-136  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 		 1022 aa  485  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  29.33 
 
 		 1036 aa  483  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1038 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  30.09 
 
 		 1062 aa  484  1e-135  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 		 1044 aa  486  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 		 1101 aa  485  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  30.4 
 
 		 1034 aa  482  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  30.73 
 
 		 1013 aa  480  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  30.88 
 
 		 1058 aa  482  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.66 
 
 		 1046 aa  483  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  30.15 
 
 		 1017 aa  481  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1050 aa  479  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  29.96 
 
 		 1051 aa  477  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0466  acriflavin resistance protein  31.5 
 
 		 1031 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0468485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 		 1026 aa  477  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1035 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 		 1022 aa  476  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1031 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 		 1048 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 		 1044 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  28.69 
 
 		 1037 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0885  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1053 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0557  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  30.84 
 
 		 1046 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644093  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1018 aa  471  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 		 1048 aa  472  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  29.2 
 
 		 1031 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1009 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 		 1032 aa  468  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1171 aa  465  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  29.1 
 
 		 1038 aa  463  1e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 		 1026 aa  463  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0397  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1031 aa  465  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.675147 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0686  RND transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) and heavy metal efflux (HME) families, permease protein  30.56 
 
 		 1008 aa  463  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 		 1031 aa  465  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  28.91 
 
 		 1177 aa  459  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1043 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0430  acriflavin resistance protein  31.22 
 
 		 1031 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.31117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  29.74 
 
 		 1037 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>