More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2558 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  45.01 
 
 		 1039 aa  882    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  46.32 
 
 		 1058 aa  949    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  46.68 
 
 		 1063 aa  947    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  81.01 
 
 		 1053 aa  1752    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  41.63 
 
 		 1036 aa  818    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  41.8 
 
 		 1034 aa  837    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  45.44 
 
 		 1049 aa  848    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  44.24 
 
 		 1050 aa  877    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1048 aa  2112    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  46.78 
 
 		 1059 aa  949    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  45.65 
 
 		 1040 aa  884    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  41.61 
 
 		 1046 aa  792    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  41.79 
 
 		 1055 aa  802    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  43.65 
 
 		 1041 aa  873    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  44.5 
 
 		 1058 aa  896    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  32.99 
 
 		 1058 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  34.86 
 
 		 1028 aa  582  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  34.28 
 
 		 1028 aa  579  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1011 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 		 1043 aa  575  1.0000000000000001e-162  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  34 
 
 		 1055 aa  574  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 		 1034 aa  574  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  33.85 
 
 		 1028 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  32.24 
 
 		 1038 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  32.21 
 
 		 1496 aa  557  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 		 1050 aa  555  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  32.41 
 
 		 1036 aa  548  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  33.88 
 
 		 1028 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  32.2 
 
 		 1043 aa  542  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  32.35 
 
 		 1041 aa  537  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 		 1032 aa  533  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.52 
 
 		 1024 aa  532  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  30.45 
 
 		 1470 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 		 1039 aa  520  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 		 1047 aa  515  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 		 1095 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1022 aa  514  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1065 aa  511  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 		 1070 aa  512  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  30.87 
 
 		 1044 aa  506  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 		 1038 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 		 1045 aa  503  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1177 aa  500  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.02 
 
 		 1024 aa  496  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 		 1071 aa  499  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 		 1171 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1044 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1075 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  29.66 
 
 		 1069 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1043 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 		 1101 aa  492  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 		 1044 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1040 aa  484  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1060 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1054 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  30.44 
 
 		 1044 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  29.97 
 
 		 1035 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1042 aa  481  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 		 1040 aa  481  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  29.94 
 
 		 1048 aa  482  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  31.48 
 
 		 1054 aa  482  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 		 1054 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  29.06 
 
 		 1023 aa  478  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.24 
 
 		 1046 aa  476  1e-133  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  29.54 
 
 		 1062 aa  478  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0557  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  30.65 
 
 		 1046 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644093  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1033 aa  476  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.73 
 
 		 1034 aa  476  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  29.6 
 
 		 1050 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1022 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  29.32 
 
 		 1066 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1042 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 		 1036 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0885  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 		 1053 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  29.38 
 
 		 1044 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1009 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 		 1031 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1030 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1026 aa  465  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.39 
 
 		 1049 aa  461  9.999999999999999e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  30.1 
 
 		 1073 aa  462  9.999999999999999e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  29.56 
 
 		 1029 aa  460  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1031 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  30.04 
 
 		 1088 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  30.04 
 
 		 1088 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1042 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 		 1058 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 		 1036 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1031 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  29.2 
 
 		 1031 aa  458  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 		 1034 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3262  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  29.98 
 
 		 1036 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2862  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 		 1036 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1031 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  28.94 
 
 		 1064 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  29.65 
 
 		 1034 aa  457  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.81 
 
 		 1031 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 		 1088 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  29.89 
 
 		 1031 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  28.2 
 
 		 1040 aa  455  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>