More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0557 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4107  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  52.46 
 
 		 1067 aa  996    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.666055  normal  0.120279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  42.02 
 
 		 1042 aa  785    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  45 
 
 		 1405 aa  815    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03086  transporter transmembrane protein  41.76 
 
 		 1034 aa  726    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43508  normal  0.286784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  43.27 
 
 		 1028 aa  803    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  55.01 
 
 		 1048 aa  1113    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2622  acriflavin resistance protein  40.43 
 
 		 1014 aa  715    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  41.1 
 
 		 1036 aa  764    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  43.14 
 
 		 1027 aa  794    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1374  acriflavin resistance protein  56.93 
 
 		 1028 aa  1063    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.244767  decreased coverage  0.0000403817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  80.13 
 
 		 1042 aa  1666    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  43.95 
 
 		 1035 aa  817    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  48.85 
 
 		 1088 aa  966    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3045  acriflavin resistance protein  47.67 
 
 		 1108 aa  914    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  43.75 
 
 		 1036 aa  814    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4290  acriflavin resistance protein  56.96 
 
 		 1046 aa  1105    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0982359  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3300  acriflavin resistance protein  48.58 
 
 		 1108 aa  924    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.992116  normal  0.412729 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  57.52 
 
 		 1039 aa  1149    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  44.81 
 
 		 1033 aa  819    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2927  acriflavin resistance protein  44.05 
 
 		 1009 aa  800    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0466  acriflavin resistance protein  55.98 
 
 		 1031 aa  1075    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0468485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  80.57 
 
 		 1060 aa  1659    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  41.09 
 
 		 1027 aa  768    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  80.33 
 
 		 1050 aa  1642    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0039  acriflavin resistance protein  40.38 
 
 		 1060 aa  751    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0430  acriflavin resistance protein  56.82 
 
 		 1031 aa  1059    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.31117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  43.19 
 
 		 1031 aa  807    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0885  acriflavin resistance protein  81.02 
 
 		 1053 aa  1648    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4395  acriflavin resistance protein  57.35 
 
 		 1047 aa  1111    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.882422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3023  acriflavin resistance protein  43.65 
 
 		 1027 aa  774    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  45.17 
 
 		 1031 aa  843    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  56.65 
 
 		 1037 aa  1140    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5659  acriflavin resistance protein  40.47 
 
 		 1022 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.891494  normal  0.720908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  80.08 
 
 		 1058 aa  1668    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  70.83 
 
 		 1043 aa  1412    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2375  acriflavin resistance protein  49.53 
 
 		 1103 aa  980    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  80.61 
 
 		 1040 aa  1674    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  40.78 
 
 		 1032 aa  761    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4744  acriflavin resistance protein  44.38 
 
 		 1028 aa  833    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.277916 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  44.81 
 
 		 1033 aa  819    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7283  Acr family transporter  40.22 
 
 		 1018 aa  696    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3922  acriflavin resistance protein  56.96 
 
 		 1046 aa  1106    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.081539 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7483  Acr family transporter  40.22 
 
 		 1027 aa  725    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  40.74 
 
 		 1044 aa  745    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3464  Acr family transporter  47.47 
 
 		 1101 aa  915    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5103  acriflavin resistance protein  57.53 
 
 		 1044 aa  1111    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.869946 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5613  acriflavin resistance protein  40.19 
 
 		 1050 aa  766    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0557  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  100 
 
 		 1046 aa  2078    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644093  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3825  acriflavin resistance protein  57.42 
 
 		 1036 aa  1125    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  48.32 
 
 		 1088 aa  956    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0397  acriflavin resistance protein  56.62 
 
 		 1031 aa  1056    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.675147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  60.91 
 
 		 1031 aa  1235    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4034  acriflavin resistance protein  56.45 
 
 		 1037 aa  1110    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  48.94 
 
 		 1088 aa  964    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  50.2 
 
 		 1018 aa  950    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1280  acriflavin resistance protein  44.34 
 
 		 1037 aa  810    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0345102 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4664  acriflavin resistance protein  44.49 
 
 		 1025 aa  800    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  69.11 
 
 		 1044 aa  1431    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2967  acriflavin resistance protein  39.29 
 
 		 1032 aa  709    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510734  normal  0.0225941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  43.63 
 
 		 1044 aa  827    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  45.41 
 
 		 1031 aa  846    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  41.49 
 
 		 1083 aa  775    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  36.04 
 
 		 1028 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  32 
 
 		 1038 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  35.84 
 
 		 1028 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 		 1496 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1032 aa  525  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  36.33 
 
 		 1028 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  33.05 
 
 		 1470 aa  521  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 		 1065 aa  521  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  33.21 
 
 		 1039 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  31.74 
 
 		 1069 aa  509  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  33.85 
 
 		 1067 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  33.88 
 
 		 1041 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  34.04 
 
 		 1028 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1036 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  34.57 
 
 		 1055 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  34.19 
 
 		 1054 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  30.89 
 
 		 1095 aa  504  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  34.09 
 
 		 1054 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1053 aa  495  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  34.1 
 
 		 1054 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1070 aa  494  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 		 1075 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 		 1050 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1033 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1058 aa  479  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.43 
 
 		 1024 aa  476  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1071 aa  472  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  30.22 
 
 		 1034 aa  473  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1062 aa  467  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  30.66 
 
 		 1068 aa  466  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  30.68 
 
 		 1009 aa  463  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 		 1048 aa  466  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0472  acriflavin resistance protein  48.63 
 
 		 1138 aa  465  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  29.04 
 
 		 1022 aa  464  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  30.12 
 
 		 1058 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  31.38 
 
 		 1036 aa  457  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 		 1066 aa  458  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  29.74 
 
 		 1022 aa  456  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>