More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2523 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  64.11 
 
 		 1028 aa  1219    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  37.54 
 
 		 1050 aa  679    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  37.72 
 
 		 1011 aa  695    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  45.46 
 
 		 1017 aa  816    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  45.58 
 
 		 1024 aa  783    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  53.09 
 
 		 1027 aa  977    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  47.21 
 
 		 1027 aa  813    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1026 aa  2029    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  36.29 
 
 		 1034 aa  634  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  38.01 
 
 		 1044 aa  631  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  39.09 
 
 		 1043 aa  627  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1044 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  36.94 
 
 		 1034 aa  625  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  35.22 
 
 		 1043 aa  599  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  35.33 
 
 		 1040 aa  595  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 		 1038 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 		 1046 aa  570  1e-161  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.6 
 
 		 1024 aa  559  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 		 1034 aa  554  1e-156  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.94 
 
 		 1049 aa  550  1e-155  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1039 aa  549  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1044 aa  544  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 		 1470 aa  544  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  32.9 
 
 		 1069 aa  534  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  34.34 
 
 		 1050 aa  530  1e-149  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1023 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  34.11 
 
 		 1039 aa  532  1e-149  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  33.91 
 
 		 1041 aa  528  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 		 1036 aa  528  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1038 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 		 1032 aa  525  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1058 aa  523  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.15 
 
 		 1081 aa  523  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  32.66 
 
 		 1071 aa  522  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  32.68 
 
 		 1496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 		 1070 aa  518  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  32.05 
 
 		 1095 aa  519  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  33.04 
 
 		 1036 aa  514  1e-144  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  32 
 
 		 1065 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 		 1041 aa  512  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 		 1058 aa  510  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  32.72 
 
 		 1040 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1059 aa  507  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  31.45 
 
 		 1173 aa  509  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1055 aa  509  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1053 aa  508  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1041 aa  505  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  31.89 
 
 		 1075 aa  505  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1026 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  33.73 
 
 		 1028 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1028 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1063 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1066 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1095 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  31.59 
 
 		 1006 aa  493  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  35.38 
 
 		 1057 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1046 aa  491  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.4 
 
 		 1024 aa  486  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 		 1048 aa  486  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1041 aa  483  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 		 1058 aa  485  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  31.7 
 
 		 1050 aa  481  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 		 1028 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1049 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1044 aa  474  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1062 aa  473  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  31.25 
 
 		 1043 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1047 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1054 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  32.11 
 
 		 1033 aa  469  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 		 1029 aa  465  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 		 1045 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  33.7 
 
 		 1038 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 		 1054 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1044 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 		 1054 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1067 aa  459  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1051 aa  459  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1087 aa  457  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  30.72 
 
 		 1073 aa  455  1.0000000000000001e-126  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  31.83 
 
 		 1037 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1028 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  29.48 
 
 		 1014 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  29.54 
 
 		 1040 aa  452  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1069 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  31.63 
 
 		 1035 aa  449  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 		 1031 aa  444  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1030 aa  445  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 		 1055 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 		 1064 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  31.04 
 
 		 1036 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_003296  RS02154  transport transmembrane protein  31 
 
 		 1064 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  32.15 
 
 		 1064 aa  439  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2979  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1079 aa  439  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  29.03 
 
 		 1009 aa  437  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 		 1070 aa  437  1e-121  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  30.55 
 
 		 1042 aa  439  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 		 1031 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1040 aa  436  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5687  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1084 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>