More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2296 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2548  acriflavin resistance protein  48.81 
 
 		 1028 aa  742    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  60.95 
 
 		 1067 aa  1127    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02800  cation/multidrug efflux pump  45.59 
 
 		 1121 aa  773    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  100 
 
 		 1064 aa  2097    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  49.91 
 
 		 1074 aa  978    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3454  acriflavin resistance protein  46.29 
 
 		 1089 aa  820    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  0.0107739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3649  acriflavin resistance protein  50.79 
 
 		 1104 aa  893    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  46.05 
 
 		 1075 aa  825    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4438  hypothetical protein  51.76 
 
 		 1089 aa  943    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0339173  hitchhiker  0.00783982 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0919  acriflavin resistance protein  50.48 
 
 		 1040 aa  809    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16282  normal  0.511424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6163  hypothetical protein  49.52 
 
 		 1028 aa  832    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367103  hitchhiker  0.000303541 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08430  heavy metal efflux pump, cobalt-zinc-cadmium  46 
 
 		 1077 aa  766    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.295378  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07530  cation/multidrug efflux pump  48.44 
 
 		 1062 aa  818    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.417061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  52.19 
 
 		 1065 aa  964    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  46.51 
 
 		 1072 aa  816    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4031  acriflavin resistance protein  51.18 
 
 		 1097 aa  855    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  35.65 
 
 		 1016 aa  552  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1011 aa  544  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 		 1043 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  34.22 
 
 		 1050 aa  537  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1044 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5289  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  34.52 
 
 		 1038 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5686  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  34.52 
 
 		 1038 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  34.37 
 
 		 1034 aa  530  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5560  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  34.42 
 
 		 1038 aa  530  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5114  transporter; acriflavin resistance protein  34.42 
 
 		 1038 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5131  transporter; acriflavin resistance protein  34.32 
 
 		 1038 aa  527  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5616  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  34.42 
 
 		 1038 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  34.53 
 
 		 1015 aa  529  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5229  acriflavin resistance protein  33.75 
 
 		 1038 aa  526  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5568  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  34.1 
 
 		 1039 aa  523  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5389  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  34.13 
 
 		 1038 aa  525  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.433954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5530  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  34.32 
 
 		 1038 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2287  acriflavin resistance protein  31.72 
 
 		 1055 aa  522  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2328  acriflavin resistance protein  31.72 
 
 		 1055 aa  522  1e-146  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3953  acriflavin resistance protein  33.87 
 
 		 1039 aa  519  1.0000000000000001e-145  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1418  integral membrane efflux protein  32.49 
 
 		 1004 aa  509  1e-143  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.133612  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  34.46 
 
 		 1043 aa  509  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1843  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.27 
 
 		 1051 aa  505  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0542827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.91 
 
 		 1014 aa  500  1e-140  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4317  acriflavin resistance protein  39.38 
 
 		 1263 aa  498  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  32.48 
 
 		 1023 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0685  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.53 
 
 		 1014 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0629  acriflavin resistance protein  31.62 
 
 		 1014 aa  487  1e-136  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0719  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.53 
 
 		 1014 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0847  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.72 
 
 		 1014 aa  488  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000146243  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0629  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1014 aa  479  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0312217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0606  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 		 1014 aa  479  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0459502  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  32.01 
 
 		 1034 aa  477  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4583  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.43 
 
 		 980 aa  475  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0441702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0788  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.47 
 
 		 1014 aa  469  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1044 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  30.89 
 
 		 1053 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1041 aa  464  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 		 1034 aa  462  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  30.9 
 
 		 1036 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0774  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.58 
 
 		 955 aa  456  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66679e-17 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.18 
 
 		 1049 aa  451  1e-125  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  30.28 
 
 		 1050 aa  451  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  30.62 
 
 		 1040 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 		 1058 aa  443  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1039 aa  443  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 		 1173 aa  446  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 		 1046 aa  445  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1026 aa  441  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  30.06 
 
 		 1044 aa  437  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  29.46 
 
 		 1048 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  29.23 
 
 		 1063 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.47 
 
 		 1046 aa  431  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 		 1095 aa  432  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  30.02 
 
 		 1496 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 		 1032 aa  428  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.8 
 
 		 1024 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1055 aa  425  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  29.79 
 
 		 1059 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1028 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  29.57 
 
 		 1065 aa  422  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  29.65 
 
 		 1075 aa  422  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 		 1070 aa  418  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  29.02 
 
 		 1069 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  29.48 
 
 		 1055 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1028 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1058 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1039 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 		 1067 aa  416  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  29.58 
 
 		 1040 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 		 1035 aa  416  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 		 1033 aa  415  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  29.7 
 
 		 1041 aa  412  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  29.84 
 
 		 1054 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1006 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1470 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  28.32 
 
 		 1048 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  29.84 
 
 		 1054 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  29.3 
 
 		 1071 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 		 1031 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1054 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 		 1051 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 		 1058 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.9 
 
 		 1038 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>