More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2503 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5560  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  38.37 
 
 		 1038 aa  649    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5568  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  38.31 
 
 		 1039 aa  646    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5289  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  38.27 
 
 		 1038 aa  646    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5114  transporter; acriflavin resistance protein  38.27 
 
 		 1038 aa  646    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5131  transporter; acriflavin resistance protein  38.08 
 
 		 1038 aa  644    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5530  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  38.17 
 
 		 1038 aa  643    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5686  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  38.27 
 
 		 1038 aa  646    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1016 aa  2024    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  73.62 
 
 		 1015 aa  1509    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5616  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  38.37 
 
 		 1038 aa  645    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5229  acriflavin resistance protein  38.25 
 
 		 1038 aa  642    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5389  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  38.08 
 
 		 1038 aa  644    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.433954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3953  acriflavin resistance protein  38.11 
 
 		 1039 aa  633  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  34.97 
 
 		 1014 aa  556  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2287  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 		 1055 aa  548  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2328  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 		 1055 aa  548  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0629  acriflavin resistance protein  34.9 
 
 		 1014 aa  543  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0847  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  34.71 
 
 		 1014 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000146243  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0685  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  34.8 
 
 		 1014 aa  542  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0629  acriflavin resistance protein  34.61 
 
 		 1014 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0312217  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0719  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  34.8 
 
 		 1014 aa  542  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0788  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  34.71 
 
 		 1014 aa  535  1e-150  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  34.8 
 
 		 1074 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1843  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.43 
 
 		 1051 aa  527  1e-148  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0542827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0606  acriflavin resistance protein  34.4 
 
 		 1014 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0459502  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  35.71 
 
 		 1064 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  35.46 
 
 		 1065 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4583  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  34.04 
 
 		 980 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0441702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  33.99 
 
 		 1072 aa  506  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 		 1075 aa  498  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07530  cation/multidrug efflux pump  33.79 
 
 		 1062 aa  494  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.417061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6163  hypothetical protein  32.94 
 
 		 1028 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367103  hitchhiker  0.000303541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3649  acriflavin resistance protein  33.76 
 
 		 1104 aa  491  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0774  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  34.24 
 
 		 955 aa  492  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66679e-17 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3454  acriflavin resistance protein  33.18 
 
 		 1089 aa  488  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  0.0107739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02800  cation/multidrug efflux pump  32.89 
 
 		 1121 aa  483  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08430  heavy metal efflux pump, cobalt-zinc-cadmium  34.4 
 
 		 1077 aa  481  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.295378  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  32.41 
 
 		 1067 aa  476  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  30.09 
 
 		 1050 aa  467  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4317  acriflavin resistance protein  37.94 
 
 		 1263 aa  464  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1044 aa  465  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4031  acriflavin resistance protein  34.09 
 
 		 1097 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4438  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1089 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0339173  hitchhiker  0.00783982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1034 aa  459  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1023 aa  458  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  29.1 
 
 		 1011 aa  445  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 		 1043 aa  436  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0919  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 		 1040 aa  420  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16282  normal  0.511424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  30.67 
 
 		 1044 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1418  integral membrane efflux protein  29.44 
 
 		 1004 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.133612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2548  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1028 aa  412  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  29.05 
 
 		 1043 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  29.7 
 
 		 1039 aa  404  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  28.81 
 
 		 1055 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1034 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1055 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 		 1053 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1058 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.93 
 
 		 1040 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  29.84 
 
 		 1050 aa  393  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  29.13 
 
 		 1063 aa  396  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.54 
 
 		 1036 aa  391  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1040 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1038 aa  386  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  26.83 
 
 		 1041 aa  383  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  27.89 
 
 		 1058 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  28.69 
 
 		 1041 aa  379  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  28.68 
 
 		 1086 aa  376  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.27 
 
 		 1034 aa  372  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.09 
 
 		 1024 aa  372  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1006 aa  369  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1101 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1039 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  29.73 
 
 		 1027 aa  366  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  27.21 
 
 		 1048 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1059 aa  364  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  29.76 
 
 		 1085 aa  362  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0140  acriflavine resistance protein  29.88 
 
 		 1071 aa  362  3e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1085 aa  361  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 		 1087 aa  361  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1085 aa  360  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1087 aa  360  7e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1085 aa  360  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.47 
 
 		 1091 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.48 
 
 		 1081 aa  357  5e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1083 aa  357  6.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  29.66 
 
 		 1087 aa  357  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1014 aa  357  8.999999999999999e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1051 aa  355  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 		 1027 aa  354  5e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1070 aa  354  5e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 		 1054 aa  354  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 		 1054 aa  351  4e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1041 aa  350  7e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  29.08 
 
 		 1102 aa  350  8e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  28.28 
 
 		 1044 aa  350  8e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0545  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 		 1008 aa  350  9e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000592729  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  28.35 
 
 		 1049 aa  350  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0559  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 		 1000 aa  350  1e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0052837  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1017 aa  349  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>