More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3454 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4031  acriflavin resistance protein  46.84 
 
 		 1097 aa  753    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115859 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  48.6 
 
 		 1065 aa  855    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0919  acriflavin resistance protein  51.13 
 
 		 1040 aa  817    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16282  normal  0.511424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3649  acriflavin resistance protein  47.99 
 
 		 1104 aa  804    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  47.15 
 
 		 1064 aa  845    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4438  hypothetical protein  48.34 
 
 		 1089 aa  823    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0339173  hitchhiker  0.00783982 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02800  cation/multidrug efflux pump  46.69 
 
 		 1121 aa  820    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08430  heavy metal efflux pump, cobalt-zinc-cadmium  46.68 
 
 		 1077 aa  771    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.295378  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2548  acriflavin resistance protein  45.7 
 
 		 1028 aa  689    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  44.15 
 
 		 1067 aa  763    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  44.56 
 
 		 1074 aa  822    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  52.26 
 
 		 1075 aa  949    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07530  cation/multidrug efflux pump  46.88 
 
 		 1062 aa  805    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.417061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6163  hypothetical protein  43.09 
 
 		 1028 aa  709    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367103  hitchhiker  0.000303541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  50.93 
 
 		 1072 aa  935    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3454  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1089 aa  2100    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  0.0107739 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  34.45 
 
 		 1015 aa  538  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  33.52 
 
 		 1016 aa  531  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5229  acriflavin resistance protein  32.74 
 
 		 1038 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5616  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  32.87 
 
 		 1038 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5560  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  32.87 
 
 		 1038 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1418  integral membrane efflux protein  33.39 
 
 		 1004 aa  514  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.133612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5289  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  32.77 
 
 		 1038 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5114  transporter; acriflavin resistance protein  32.77 
 
 		 1038 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5131  transporter; acriflavin resistance protein  32.77 
 
 		 1038 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5686  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  32.77 
 
 		 1038 aa  514  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5389  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  32.68 
 
 		 1038 aa  515  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.433954  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5568  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  32.33 
 
 		 1039 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5530  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  32.59 
 
 		 1038 aa  509  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1050 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3953  acriflavin resistance protein  32.74 
 
 		 1039 aa  505  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1011 aa  488  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 		 1034 aa  485  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 		 1023 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.12 
 
 		 1043 aa  473  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4317  acriflavin resistance protein  38.48 
 
 		 1263 aa  471  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 		 1043 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  30.06 
 
 		 1053 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2287  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 		 1055 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2328  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 		 1055 aa  447  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 		 1055 aa  441  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1044 aa  442  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1843  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.37 
 
 		 1051 aa  438  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0542827  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  30.06 
 
 		 1036 aa  432  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  29.27 
 
 		 1014 aa  426  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1040 aa  425  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0606  acriflavin resistance protein  29.04 
 
 		 1014 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0459502  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0685  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  29.49 
 
 		 1014 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0629  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1014 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0719  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  29.49 
 
 		 1014 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  30.7 
 
 		 1044 aa  423  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.44 
 
 		 1046 aa  420  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.96 
 
 		 1024 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0847  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  29.29 
 
 		 1014 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000146243  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.86 
 
 		 1049 aa  413  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4583  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  29.86 
 
 		 980 aa  415  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0441702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0629  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1014 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0312217  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2104  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  30.11 
 
 		 1034 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  29.73 
 
 		 1048 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.32 
 
 		 1034 aa  410  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  31.28 
 
 		 1095 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1761  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1034 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1083 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 		 1039 aa  402  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 		 1055 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  28.69 
 
 		 1041 aa  397  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 		 1173 aa  399  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1034 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1041 aa  396  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.84 
 
 		 1039 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0788  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  29.04 
 
 		 1014 aa  392  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 		 1028 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1058 aa  392  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  30.26 
 
 		 1054 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1041 aa  391  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1054 aa  393  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.45 
 
 		 1081 aa  393  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28.93 
 
 		 1496 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  28.69 
 
 		 1036 aa  387  1e-106  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.66 
 
 		 1041 aa  389  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0774  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  29.34 
 
 		 955 aa  388  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66679e-17 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1054 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1045 aa  389  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1058 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  28.49 
 
 		 1069 aa  389  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1085 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.76 
 
 		 1032 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1085 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  27.99 
 
 		 1059 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 		 1038 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 		 1085 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1028 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  31.34 
 
 		 1087 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1087 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2968  multidrug efflux system subunit MdtC  30.15 
 
 		 1026 aa  386  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1095 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1310  multidrug efflux system subunit MdtC  30.25 
 
 		 1026 aa  382  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  31.37 
 
 		 1087 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1102 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 		 1085 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>