More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1829 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  93.44 
 
 		 1091 aa  1991    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  34.6 
 
 		 1044 aa  639    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2529  acriflavin resistance protein  42.43 
 
 		 1213 aa  735    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1085 aa  2182    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  81.72 
 
 		 1082 aa  1764    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  83.16 
 
 		 1086 aa  1785    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  37.5 
 
 		 1011 aa  677    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  99.54 
 
 		 1085 aa  2173    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  36.53 
 
 		 1050 aa  658    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  82.1 
 
 		 1102 aa  1769    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  54.07 
 
 		 1122 aa  1106    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00323  RND superfamily protein  43.22 
 
 		 1166 aa  773    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  36.94 
 
 		 1043 aa  640    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  82.22 
 
 		 1087 aa  1763    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  45.94 
 
 		 1173 aa  920    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  78.68 
 
 		 1095 aa  1682    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  36.47 
 
 		 1043 aa  660    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2230  acriflavin resistance protein  54.4 
 
 		 1156 aa  1103    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  94.65 
 
 		 1083 aa  2006    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  99.82 
 
 		 1085 aa  2178    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  94 
 
 		 1087 aa  2005    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  93.72 
 
 		 1087 aa  1998    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  81.48 
 
 		 1083 aa  1743    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  35.38 
 
 		 1034 aa  639    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  99.63 
 
 		 1085 aa  2174    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  94.11 
 
 		 1087 aa  2005    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  78.11 
 
 		 1081 aa  1667    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  36.48 
 
 		 1044 aa  621  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  34.54 
 
 		 1040 aa  619  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  37.25 
 
 		 1027 aa  600  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  34.2 
 
 		 1046 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  35.52 
 
 		 1017 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  35.91 
 
 		 1027 aa  551  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.39 
 
 		 1055 aa  538  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  31.82 
 
 		 1038 aa  533  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  31.19 
 
 		 1044 aa  530  1e-149  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 		 1038 aa  525  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  34.29 
 
 		 1028 aa  515  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 		 1050 aa  505  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  30.73 
 
 		 1058 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1032 aa  498  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.72 
 
 		 1049 aa  495  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.73 
 
 		 1024 aa  496  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1071 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  30.74 
 
 		 1470 aa  488  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  30.67 
 
 		 1496 aa  486  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1041 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1087 aa  477  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1041 aa  478  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.56 
 
 		 1053 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 		 1069 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1070 aa  473  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1039 aa  475  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1045 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 		 1070 aa  462  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  30 
 
 		 1036 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  29.3 
 
 		 1036 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1028 aa  459  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1039 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 		 1048 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.08 
 
 		 1024 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  31.33 
 
 		 1044 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  29.9 
 
 		 1051 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  30.63 
 
 		 1040 aa  450  1e-125  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1101 aa  450  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  29.35 
 
 		 1095 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  29.4 
 
 		 1026 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1022 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  29.66 
 
 		 1069 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  29.24 
 
 		 1050 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 		 1030 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1034 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  29.48 
 
 		 1063 aa  442  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  28.77 
 
 		 1073 aa  437  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2381  acriflavin resistance protein D  29.46 
 
 		 1092 aa  438  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.422424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  29.73 
 
 		 1031 aa  439  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1075 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2979  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 		 1079 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  28.41 
 
 		 1014 aa  433  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1065 aa  435  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1033 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  28.74 
 
 		 1048 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 		 1031 aa  432  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1066 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 		 1059 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1055 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1037 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  29.7 
 
 		 1046 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.44 
 
 		 1034 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1177 aa  429  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1869  cation efflux system protein  32.64 
 
 		 1084 aa  428  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.443113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  29.06 
 
 		 1034 aa  429  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  28.05 
 
 		 1058 aa  429  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1055 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 		 1058 aa  425  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 		 1171 aa  426  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28 
 
 		 1068 aa  426  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1031 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 		 1057 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  28.32 
 
 		 1031 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>