More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2821 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  82.22 
 
 		 1085 aa  1762    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  82.88 
 
 		 1091 aa  1759    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  82.22 
 
 		 1085 aa  1761    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  81.41 
 
 		 1083 aa  1745    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  86.94 
 
 		 1082 aa  1873    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  35.55 
 
 		 1043 aa  652    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  36.3 
 
 		 1050 aa  648    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  91.72 
 
 		 1086 aa  1989    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  89.86 
 
 		 1102 aa  1939    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  82.31 
 
 		 1085 aa  1765    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  76.85 
 
 		 1095 aa  1647    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1087 aa  2182    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00323  RND superfamily protein  42.64 
 
 		 1166 aa  748    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  44.07 
 
 		 1173 aa  883    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2230  acriflavin resistance protein  52.25 
 
 		 1156 aa  1085    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  83.46 
 
 		 1087 aa  1771    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  83.46 
 
 		 1087 aa  1768    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2529  acriflavin resistance protein  42.18 
 
 		 1213 aa  741    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  79.79 
 
 		 1083 aa  1715    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  52.94 
 
 		 1122 aa  1092    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  82.22 
 
 		 1085 aa  1763    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  83.72 
 
 		 1087 aa  1769    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  78.41 
 
 		 1081 aa  1667    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  33.95 
 
 		 1034 aa  624  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  36.93 
 
 		 1044 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  33.95 
 
 		 1044 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  35.99 
 
 		 1043 aa  597  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  33.94 
 
 		 1040 aa  592  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  34.56 
 
 		 1024 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  33.15 
 
 		 1034 aa  562  1.0000000000000001e-159  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  33.7 
 
 		 1023 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  33.76 
 
 		 1046 aa  553  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  34.45 
 
 		 1017 aa  550  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  34.45 
 
 		 1027 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1044 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  30.85 
 
 		 1038 aa  509  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 		 1038 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  32.97 
 
 		 1050 aa  500  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  30.99 
 
 		 1041 aa  492  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30 
 
 		 1049 aa  483  1e-135  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1058 aa  482  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1071 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1032 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 		 1069 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 		 1470 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  29.56 
 
 		 1041 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1041 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 		 1026 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1070 aa  459  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.66 
 
 		 1039 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  30.31 
 
 		 1039 aa  459  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.43 
 
 		 1496 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  29.4 
 
 		 1070 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.22 
 
 		 1053 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1095 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.65 
 
 		 1024 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  29.18 
 
 		 1069 aa  445  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1026 aa  444  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  29.89 
 
 		 1041 aa  444  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  29.62 
 
 		 1036 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1087 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1034 aa  437  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  28.74 
 
 		 1036 aa  438  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  30.68 
 
 		 1057 aa  439  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 		 1031 aa  434  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  29.46 
 
 		 1048 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1065 aa  432  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  30.17 
 
 		 1028 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  29.61 
 
 		 1030 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  29.2 
 
 		 1051 aa  428  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  29.91 
 
 		 1028 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2979  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1079 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1038 aa  425  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  29.94 
 
 		 1042 aa  425  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 		 1022 aa  422  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  29.23 
 
 		 1034 aa  420  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 		 1075 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 		 1028 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  28.79 
 
 		 1050 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  29.94 
 
 		 1040 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 		 1177 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  29.54 
 
 		 1074 aa  416  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  27.59 
 
 		 1058 aa  419  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1869  cation efflux system protein  32.16 
 
 		 1084 aa  418  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.443113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  30.55 
 
 		 1101 aa  419  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.81 
 
 		 1034 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  28.55 
 
 		 1006 aa  418  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 		 1014 aa  419  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  27.94 
 
 		 1073 aa  413  1e-114  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 		 1037 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 		 1066 aa  413  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  29.03 
 
 		 1031 aa  416  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  27.99 
 
 		 1059 aa  416  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  28.32 
 
 		 1037 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1058 aa  412  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3520  acriflavin resistance protein  29.84 
 
 		 1061 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2586  acriflavin resistance protein  29.84 
 
 		 1061 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1031 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  30.15 
 
 		 1046 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  29.43 
 
 		 1033 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>