More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1937 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  39.01 
 
 
1043 aa  721    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  42.13 
 
 
1050 aa  837    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  42.81 
 
 
1011 aa  814    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  37.95 
 
 
1044 aa  772    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  40.65 
 
 
1043 aa  750    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  38.49 
 
 
1027 aa  648    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  40.62 
 
 
1034 aa  813    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1034 aa  2031    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  49.47 
 
 
1040 aa  976    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  38.65 
 
 
1044 aa  735    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  35.89 
 
 
1017 aa  632  1e-179  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  34.88 
 
 
1046 aa  613  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  37.17 
 
 
1028 aa  612  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  37.04 
 
 
1026 aa  612  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  34.66 
 
 
1023 aa  601  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 
1071 aa  596  1e-169  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  34.67 
 
 
1027 aa  588  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.29 
 
 
1081 aa  588  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 
1065 aa  585  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 
1044 aa  580  1e-164  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 
1055 aa  579  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.49 
 
 
1049 aa  574  1.0000000000000001e-162  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 
1083 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 
1041 aa  575  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.75 
 
 
1024 aa  572  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  35.39 
 
 
1024 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  32.31 
 
 
1083 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  35.1 
 
 
1050 aa  567  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 
1041 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 
1038 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  32.46 
 
 
1069 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  32.24 
 
 
1095 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  34.19 
 
 
1028 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.79 
 
 
1091 aa  558  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 
1028 aa  555  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  34.26 
 
 
1028 aa  555  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 
1039 aa  555  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 
1095 aa  551  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  33.52 
 
 
1087 aa  551  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  32.35 
 
 
1058 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 
1040 aa  548  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  30.79 
 
 
1032 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.79 
 
 
1122 aa  545  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 
1070 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  31.03 
 
 
1038 aa  545  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 
1041 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.83 
 
 
1496 aa  537  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  32.3 
 
 
1050 aa  536  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  32.02 
 
 
1039 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 
1173 aa  535  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 
1470 aa  526  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  31.86 
 
 
1006 aa  528  1e-148  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  31.12 
 
 
1047 aa  525  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 
1066 aa  521  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  32.38 
 
 
1048 aa  522  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 
1036 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 
1031 aa  518  1.0000000000000001e-145  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 
1051 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  30.73 
 
 
1075 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 
1058 aa  506  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.51 
 
 
1024 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  29.62 
 
 
1055 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 
1062 aa  500  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  33.13 
 
 
1028 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  30.42 
 
 
1053 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 
1058 aa  500  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 
1034 aa  498  1e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 
1041 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  32.5 
 
 
1057 aa  495  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  29.06 
 
 
1040 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 
1073 aa  489  1e-137  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 
1059 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 
1069 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.21 
 
 
1054 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 
1063 aa  489  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  31.5 
 
 
1033 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  28.67 
 
 
1036 aa  483  1e-135  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 
1026 aa  484  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 
1014 aa  485  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  32.01 
 
 
1054 aa  486  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 
1067 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  32.11 
 
 
1054 aa  483  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 
1027 aa  473  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  32.71 
 
 
1009 aa  473  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  28.44 
 
 
1022 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0140  acriflavine resistance protein  31.5 
 
 
1071 aa  470  1.0000000000000001e-131  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  29.93 
 
 
1031 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  29.93 
 
 
1049 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 
1030 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2346  acriflavin resistance protein  28.85 
 
 
1024 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.322733  hitchhiker  0.00300678 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 
1033 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 
1048 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3831  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 
1024 aa  466  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 
1033 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  30.13 
 
 
1035 aa  464  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  29.07 
 
 
1087 aa  460  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5613  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 
1050 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 
1070 aa  458  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  28.97 
 
 
1029 aa  459  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 
1022 aa  459  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>