More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1350 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  47.25 
 
 		 1028 aa  768    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  38.01 
 
 		 1050 aa  648    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1024 aa  2011    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  38.35 
 
 		 1011 aa  689    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  49.26 
 
 		 1017 aa  849    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  51.51 
 
 		 1027 aa  862    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  37.45 
 
 		 1034 aa  648    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  57.98 
 
 		 1027 aa  1041    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  45.58 
 
 		 1026 aa  773    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1044 aa  619  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  37.52 
 
 		 1043 aa  599  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  35.18 
 
 		 1086 aa  589  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  35.23 
 
 		 1034 aa  580  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  34.9 
 
 		 1043 aa  582  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 		 1044 aa  578  1.0000000000000001e-163  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  35.56 
 
 		 1040 aa  578  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  35.42 
 
 		 1044 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.81 
 
 		 1081 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1046 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.31 
 
 		 1091 aa  561  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  35.1 
 
 		 1087 aa  561  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  35.16 
 
 		 1055 aa  558  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  34.82 
 
 		 1087 aa  552  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  34.91 
 
 		 1087 aa  552  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1023 aa  526  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1041 aa  528  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 		 1034 aa  523  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.04 
 
 		 1024 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  32.31 
 
 		 1041 aa  520  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  31.33 
 
 		 1039 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 		 1050 aa  514  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1173 aa  509  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1046 aa  505  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1095 aa  503  1e-140  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  32.94 
 
 		 1470 aa  502  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  30.26 
 
 		 1038 aa  502  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  32.14 
 
 		 1036 aa  498  1e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  33.99 
 
 		 1028 aa  499  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 		 1038 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  33.96 
 
 		 1028 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  32.66 
 
 		 1041 aa  492  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.52 
 
 		 1049 aa  489  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.55 
 
 		 1122 aa  486  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  33.47 
 
 		 1028 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1006 aa  486  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1032 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  29.13 
 
 		 1058 aa  477  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 		 1058 aa  479  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 		 1039 aa  473  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  31.71 
 
 		 1069 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 		 1040 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 		 1058 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  32.64 
 
 		 1071 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1036 aa  469  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.77 
 
 		 1496 aa  466  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1014 aa  466  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.76 
 
 		 1063 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1070 aa  462  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  28.76 
 
 		 1040 aa  462  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  29.04 
 
 		 1050 aa  460  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  31.03 
 
 		 1009 aa  456  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  33.6 
 
 		 1038 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  31.89 
 
 		 1026 aa  456  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1049 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  33.89 
 
 		 1045 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 		 1030 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  34.09 
 
 		 1028 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1095 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  31.91 
 
 		 1031 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 		 1029 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.76 
 
 		 1059 aa  452  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  31.62 
 
 		 1087 aa  452  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1022 aa  452  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  29.43 
 
 		 1055 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1029 aa  452  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1065 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  29.79 
 
 		 1041 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.38 
 
 		 1053 aa  447  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  34.49 
 
 		 1057 aa  449  1.0000000000000001e-124  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  32.12 
 
 		 1069 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1031 aa  449  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  31.91 
 
 		 1048 aa  444  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  32.01 
 
 		 1033 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  31.07 
 
 		 1034 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.07 
 
 		 1031 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  33.6 
 
 		 1044 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 		 1101 aa  442  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 		 1048 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.89 
 
 		 1024 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1043 aa  438  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  30.46 
 
 		 1013 aa  438  1e-121  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 		 1051 aa  439  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 		 1075 aa  439  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  31.85 
 
 		 1067 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1042 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1031 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1031 aa  435  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1031 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1031 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1031 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>