More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1613 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  42.41 
 
 		 1055 aa  833    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  43.65 
 
 		 1048 aa  852    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  46.57 
 
 		 1040 aa  912    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  75.15 
 
 		 1034 aa  1583    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  46.53 
 
 		 1049 aa  890    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  71.66 
 
 		 1036 aa  1476    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  43.52 
 
 		 1053 aa  877    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  47.92 
 
 		 1059 aa  952    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  43.79 
 
 		 1039 aa  886    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  45.25 
 
 		 1050 aa  896    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  44.56 
 
 		 1058 aa  882    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  45.59 
 
 		 1058 aa  905    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  34.77 
 
 		 1058 aa  649    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  46.6 
 
 		 1063 aa  941    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  76.83 
 
 		 1046 aa  1526    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1041 aa  2077    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  34.17 
 
 		 1034 aa  610  1e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  34.43 
 
 		 1011 aa  600  1e-170  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1050 aa  593  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  32.79 
 
 		 1038 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.95 
 
 		 1055 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1044 aa  571  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  32.76 
 
 		 1470 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 		 1043 aa  552  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  33.1 
 
 		 1028 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 		 1028 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1043 aa  549  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  32.76 
 
 		 1496 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.84 
 
 		 1024 aa  545  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  32.57 
 
 		 1047 aa  545  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 		 1095 aa  541  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 		 1032 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.33 
 
 		 1024 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  33.92 
 
 		 1028 aa  534  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1041 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1044 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1036 aa  525  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  32.31 
 
 		 1065 aa  524  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1070 aa  523  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  30.85 
 
 		 1023 aa  520  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1039 aa  520  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1048 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1024 aa  514  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 		 1026 aa  514  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  32.52 
 
 		 1045 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  31.91 
 
 		 1071 aa  512  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 		 1038 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  31.29 
 
 		 1069 aa  513  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  30.31 
 
 		 1031 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.12 
 
 		 1049 aa  508  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 		 1044 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  31.5 
 
 		 1064 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  32.03 
 
 		 1028 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1177 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  34.07 
 
 		 1027 aa  505  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1067 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  31.03 
 
 		 1062 aa  500  1e-140  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  30.34 
 
 		 1171 aa  496  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 		 1075 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 		 1051 aa  497  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1006 aa  499  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  34.04 
 
 		 1026 aa  496  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  31.89 
 
 		 1040 aa  496  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  32.18 
 
 		 1035 aa  496  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1066 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1054 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  31.34 
 
 		 1054 aa  493  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 		 1042 aa  492  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 		 1033 aa  490  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1054 aa  493  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  32.35 
 
 		 1023 aa  487  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  34.87 
 
 		 1028 aa  487  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 		 1022 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1024 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1041 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  31.03 
 
 		 1042 aa  477  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  31.66 
 
 		 1041 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 		 1034 aa  476  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 		 1101 aa  478  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.59 
 
 		 1029 aa  475  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1034 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.22 
 
 		 1022 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  30.3 
 
 		 1029 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 		 1046 aa  471  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1044 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  32.22 
 
 		 1040 aa  470  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  30.1 
 
 		 1073 aa  468  9.999999999999999e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  29.65 
 
 		 1035 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1031 aa  469  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 		 1038 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5557  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.14 
 
 		 1032 aa  469  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130118  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2756  acriflavin resistance protein  32.92 
 
 		 1042 aa  466  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0866619  normal  0.681611 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  31.48 
 
 		 1041 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  29.92 
 
 		 1068 aa  465  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1035 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  30.52 
 
 		 1034 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  30.51 
 
 		 1037 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1027 aa  465  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1031 aa  464  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 		 1037 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>