More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3955 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  41.05 
 
 		 1038 aa  786    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  41.6 
 
 		 1032 aa  840    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  42.66 
 
 		 1496 aa  837    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  42.48 
 
 		 1036 aa  830    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  59.58 
 
 		 1071 aa  1241    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  44.78 
 
 		 1065 aa  894    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  39.05 
 
 		 1055 aa  692    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  42.17 
 
 		 1067 aa  754    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  42.13 
 
 		 1041 aa  819    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  42.52 
 
 		 1054 aa  740    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  43.11 
 
 		 1470 aa  820    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  72.82 
 
 		 1066 aa  1558    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  74.98 
 
 		 1095 aa  1622    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  42.34 
 
 		 1054 aa  744    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  42.34 
 
 		 1054 aa  743    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  38.03 
 
 		 1028 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  42.13 
 
 		 1039 aa  806    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  47.05 
 
 		 1033 aa  889    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1075 aa  2164    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  75.52 
 
 		 1070 aa  1582    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  68.55 
 
 		 1069 aa  1452    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  37.82 
 
 		 1028 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  37.9 
 
 		 1028 aa  629  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  35.5 
 
 		 1050 aa  616  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  35.37 
 
 		 1022 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  35.07 
 
 		 1062 aa  585  1.0000000000000001e-165  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1011 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  37.43 
 
 		 1028 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  36.87 
 
 		 1047 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1033 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  34.13 
 
 		 1101 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  34.07 
 
 		 1171 aa  559  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 		 1034 aa  562  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  32.2 
 
 		 1037 aa  557  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.73 
 
 		 1024 aa  556  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  32.86 
 
 		 1044 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  34.27 
 
 		 1026 aa  558  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  34.52 
 
 		 1043 aa  558  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  34.33 
 
 		 1177 aa  556  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  34.67 
 
 		 1044 aa  557  1e-157  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.59 
 
 		 1032 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1009 aa  555  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  32.93 
 
 		 1058 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1515  acriflavin resistance protein  33.55 
 
 		 1038 aa  554  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  35.34 
 
 		 1031 aa  554  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  35.34 
 
 		 1031 aa  555  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 		 1032 aa  551  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  34.41 
 
 		 1035 aa  552  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  32.74 
 
 		 1035 aa  550  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  32.07 
 
 		 1055 aa  550  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 		 1073 aa  546  1e-154  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  36.44 
 
 		 1045 aa  549  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4555  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1042 aa  549  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296261  normal  0.764409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  33.96 
 
 		 1044 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.79 
 
 		 1024 aa  545  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  34.78 
 
 		 1027 aa  545  1e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  32.99 
 
 		 1036 aa  543  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  36.35 
 
 		 1038 aa  546  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1941  acriflavin resistance protein  34.07 
 
 		 1041 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143318  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1856  acriflavin resistance protein  34.07 
 
 		 1041 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  34.71 
 
 		 1028 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  32.56 
 
 		 1041 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2022  acriflavin resistance protein  34.16 
 
 		 1041 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  36.79 
 
 		 1044 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  33.8 
 
 		 1036 aa  538  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  31.75 
 
 		 1058 aa  537  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1034 aa  538  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  34.13 
 
 		 1048 aa  538  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  34.58 
 
 		 1033 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  31.66 
 
 		 1029 aa  534  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  34.58 
 
 		 1033 aa  534  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  33.71 
 
 		 1032 aa  533  1e-150  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.17 
 
 		 1049 aa  531  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  34.33 
 
 		 1037 aa  530  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  33.3 
 
 		 1041 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  32.95 
 
 		 1068 aa  530  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  32.11 
 
 		 1048 aa  532  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  34.17 
 
 		 1031 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  32.38 
 
 		 1042 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1018 aa  529  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 		 1039 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1064 aa  527  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  34.56 
 
 		 1405 aa  524  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 		 1053 aa  525  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1027 aa  524  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  33.98 
 
 		 1024 aa  525  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1058 aa  525  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  33.15 
 
 		 1031 aa  525  1e-147  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 		 1063 aa  521  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1051 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1029 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  33.58 
 
 		 1036 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  31.28 
 
 		 1040 aa  519  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 		 1051 aa  519  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 		 1022 aa  513  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  30.73 
 
 		 1034 aa  513  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  32.11 
 
 		 1013 aa  514  1e-144  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 		 1041 aa  514  1e-144  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2374  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1034 aa  515  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4034  acriflavin resistance protein  34.33 
 
 		 1037 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>