More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0960 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  36.55 
 
 		 1496 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.35 
 
 		 1024 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  41.82 
 
 		 1055 aa  721    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  43.31 
 
 		 1028 aa  701    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  37.7 
 
 		 1062 aa  657    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  43.28 
 
 		 1028 aa  749    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  36.11 
 
 		 1032 aa  644    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1047 aa  2097    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  41.44 
 
 		 1028 aa  710    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  42.59 
 
 		 1028 aa  734    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  39.06 
 
 		 1039 aa  689    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  38.35 
 
 		 1470 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  37.8 
 
 		 1038 aa  662    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  36.48 
 
 		 1095 aa  635  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  37 
 
 		 1041 aa  631  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  36.69 
 
 		 1036 aa  627  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  37.16 
 
 		 1070 aa  627  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  37.85 
 
 		 1069 aa  622  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  38.09 
 
 		 1071 aa  621  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  34.54 
 
 		 1011 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  32.94 
 
 		 1014 aa  596  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  35.37 
 
 		 1048 aa  598  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  38.39 
 
 		 1045 aa  597  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  38.35 
 
 		 1038 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  34.44 
 
 		 1073 aa  593  1e-168  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  37.86 
 
 		 1026 aa  595  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  34.69 
 
 		 1068 aa  590  1e-167  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  38.55 
 
 		 1044 aa  586  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  34.13 
 
 		 1058 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 		 1046 aa  582  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  34.07 
 
 		 1050 aa  581  1e-164  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  36.87 
 
 		 1075 aa  579  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  34.89 
 
 		 1048 aa  578  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  33.97 
 
 		 1035 aa  577  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  36.84 
 
 		 1066 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  36.5 
 
 		 1023 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  35.81 
 
 		 1022 aa  579  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  35.47 
 
 		 1024 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  35.74 
 
 		 1031 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1034 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 		 1031 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1030 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1034 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  32.57 
 
 		 1041 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  35.96 
 
 		 1043 aa  575  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  33.91 
 
 		 1042 aa  567  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  36.13 
 
 		 1025 aa  565  1.0000000000000001e-159  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 		 1034 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  34.81 
 
 		 1065 aa  560  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  33.14 
 
 		 1036 aa  560  1e-158  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  36.49 
 
 		 1054 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  32.59 
 
 		 1026 aa  562  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1022 aa  562  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.85 
 
 		 1031 aa  559  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1044 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  34.06 
 
 		 1037 aa  557  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  36.49 
 
 		 1054 aa  559  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  33.91 
 
 		 1036 aa  559  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  32.53 
 
 		 1050 aa  559  1e-157  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  32.58 
 
 		 1043 aa  557  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  36.49 
 
 		 1054 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  34.54 
 
 		 1029 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1031 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1031 aa  554  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  34.41 
 
 		 1036 aa  555  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1031 aa  554  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  32.45 
 
 		 1034 aa  552  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1064 aa  552  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  32 
 
 		 1053 aa  546  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 		 1031 aa  548  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  35.05 
 
 		 1037 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  34.63 
 
 		 1037 aa  548  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 		 1031 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 		 1037 aa  546  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  31.48 
 
 		 1058 aa  547  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  32.53 
 
 		 1031 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.08 
 
 		 1034 aa  549  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  35.84 
 
 		 1067 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  32.34 
 
 		 1031 aa  545  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1044 aa  545  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  34.19 
 
 		 1013 aa  545  1e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  34.14 
 
 		 1036 aa  545  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1037 aa  545  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  35.17 
 
 		 1033 aa  544  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  32.51 
 
 		 1051 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1031 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1037 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.96 
 
 		 1029 aa  536  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 		 1058 aa  536  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 		 1009 aa  538  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  34.5 
 
 		 1042 aa  537  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  34.96 
 
 		 1038 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1040 aa  533  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  34.56 
 
 		 1038 aa  535  1e-150  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5577  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 		 1037 aa  535  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.500475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1031 aa  534  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  34.44 
 
 		 1040 aa  535  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  33.91 
 
 		 1036 aa  532  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  34.2 
 
 		 1035 aa  532  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 		 1040 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>