More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1440 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0686  RND transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) and heavy metal efflux (HME) families, permease protein  38.09 
 
 		 1008 aa  649    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0749  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.76 
 
 		 1005 aa  685    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1177  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.76 
 
 		 1005 aa  684    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  51.78 
 
 		 1009 aa  1037    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  100 
 
 		 1013 aa  2013    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0988  integral membrane component of efflux system  37.61 
 
 		 1004 aa  663    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1052  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.56 
 
 		 1005 aa  682    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  34.84 
 
 		 1055 aa  634  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  35.63 
 
 		 1028 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  35.63 
 
 		 1028 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 		 1062 aa  582  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  34.11 
 
 		 1028 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  33.05 
 
 		 1071 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  34.67 
 
 		 1028 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1039 aa  572  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  33.9 
 
 		 1047 aa  562  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 		 1470 aa  559  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1095 aa  551  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  32.11 
 
 		 1069 aa  549  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  31.84 
 
 		 1496 aa  546  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1038 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 		 1011 aa  544  1e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1031 aa  544  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  32.94 
 
 		 1026 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  32.72 
 
 		 1036 aa  537  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 		 1022 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  31.86 
 
 		 1070 aa  539  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  31.17 
 
 		 1040 aa  535  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.4 
 
 		 1032 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.98 
 
 		 1024 aa  532  1e-149  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1032 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  32.12 
 
 		 1048 aa  531  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1075 aa  531  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  29.99 
 
 		 1037 aa  527  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  31.66 
 
 		 1068 aa  528  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 		 1039 aa  524  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  31.78 
 
 		 1041 aa  523  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1856  acriflavin resistance protein  31.14 
 
 		 1041 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  31.72 
 
 		 1014 aa  523  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1941  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1041 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  30.53 
 
 		 1035 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1032 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  30.42 
 
 		 1065 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  29.04 
 
 		 1055 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 		 1033 aa  516  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  30.8 
 
 		 1037 aa  515  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  32.21 
 
 		 1038 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 		 1044 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  31.85 
 
 		 1066 aa  509  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  30.73 
 
 		 1058 aa  512  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1034 aa  510  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 		 1045 aa  513  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  32.41 
 
 		 1073 aa  511  1e-143  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  32.13 
 
 		 1048 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 		 1044 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2022  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 		 1041 aa  505  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625222  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 		 1029 aa  501  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2374  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 		 1034 aa  502  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1034 aa  501  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.52 
 
 		 1022 aa  499  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  31.79 
 
 		 1026 aa  498  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  30.93 
 
 		 1050 aa  498  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1033 aa  498  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  29.12 
 
 		 1048 aa  499  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1041 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1050 aa  494  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1029 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1031 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 		 1041 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  29.58 
 
 		 1088 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  29.29 
 
 		 1088 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  30.06 
 
 		 1042 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1088 aa  490  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2704  multidrug efflux system subunit MdtC  30.31 
 
 		 1030 aa  491  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  29.75 
 
 		 1023 aa  491  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1310  multidrug efflux system subunit MdtC  31.02 
 
 		 1026 aa  486  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2319  RND efflux transporter  30.18 
 
 		 1023 aa  488  1e-136  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1787  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 		 1044 aa  489  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.342493 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1515  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1038 aa  488  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2968  multidrug efflux system subunit MdtC  31.18 
 
 		 1026 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 		 1041 aa  488  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1043 aa  488  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  30.48 
 
 		 1059 aa  486  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  30.54 
 
 		 1028 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  30.5 
 
 		 1033 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5136  acriflavin resistance protein  32.12 
 
 		 1029 aa  486  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 		 1037 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  29.94 
 
 		 1024 aa  484  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  29.27 
 
 		 1040 aa  483  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  29.99 
 
 		 1050 aa  482  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  29.44 
 
 		 1042 aa  480  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4294  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1033 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  28.32 
 
 		 1051 aa  480  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  30.92 
 
 		 1054 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  29.12 
 
 		 1036 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  29.14 
 
 		 1063 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  30.33 
 
 		 1035 aa  483  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 		 1054 aa  480  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 		 1064 aa  481  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4182  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1033 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>