More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0988 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0988  integral membrane component of efflux system  100 
 
 		 1004 aa  1972    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1177  AcrB/AcrD/AcrF family protein  64.08 
 
 		 1005 aa  1268    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0686  RND transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) and heavy metal efflux (HME) families, permease protein  45.1 
 
 		 1008 aa  822    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0749  AcrB/AcrD/AcrF family protein  64.08 
 
 		 1005 aa  1269    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  42.72 
 
 		 1009 aa  776    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  37.66 
 
 		 1013 aa  637    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1052  AcrB/AcrD/AcrF family protein  63.88 
 
 		 1005 aa  1262    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 		 1028 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1028 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  28.59 
 
 		 1055 aa  472  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  29.46 
 
 		 1028 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1039 aa  448  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  29.46 
 
 		 1047 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  29.23 
 
 		 1038 aa  436  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1065 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  29.54 
 
 		 1028 aa  432  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.4 
 
 		 1496 aa  429  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.01 
 
 		 1050 aa  426  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1071 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1470 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 		 1034 aa  419  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1041 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1032 aa  415  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  28.19 
 
 		 1038 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1044 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  27.78 
 
 		 1035 aa  406  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1045 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  28.76 
 
 		 1036 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.65 
 
 		 1044 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26 
 
 		 1095 aa  399  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1048 aa  397  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  25.56 
 
 		 1070 aa  398  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2704  multidrug efflux system subunit MdtC  26.09 
 
 		 1030 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1075 aa  395  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  25.82 
 
 		 1062 aa  395  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5557  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27 
 
 		 1032 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130118  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1044 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  27.04 
 
 		 1022 aa  392  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1232  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1051 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.363088  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  26.84 
 
 		 1031 aa  388  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.4 
 
 		 1039 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3611  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1044 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1033 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1014 aa  389  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1034 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  26.04 
 
 		 1029 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3554  multidrug efflux system subunit MdtC  26.03 
 
 		 1026 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1026 aa  384  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  27.78 
 
 		 1040 aa  383  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  25.7 
 
 		 1055 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  25.42 
 
 		 1048 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1011 aa  385  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.47 
 
 		 1024 aa  382  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1033 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1035 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  25.27 
 
 		 1033 aa  379  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1330  multidrug efflux system subunit MdtC  25.3 
 
 		 1024 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4294  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1033 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4182  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1033 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5613  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1050 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 		 1036 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.03 
 
 		 1068 aa  379  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1043 aa  379  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  25.75 
 
 		 1069 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  28.4 
 
 		 1040 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2430  acriflavin resistance protein  27.39 
 
 		 1030 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.157087  normal  0.957896 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0733  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1083 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2968  multidrug efflux system subunit MdtC  26.98 
 
 		 1026 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.74 
 
 		 1036 aa  375  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3101  multidrug efflux system subunit MdtC  25.3 
 
 		 1024 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0416497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1310  multidrug efflux system subunit MdtC  26.59 
 
 		 1026 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  26.92 
 
 		 1058 aa  376  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1029 aa  375  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2801  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1032 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0747979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1213  multidrug efflux system subunit MdtC  25.3 
 
 		 1024 aa  376  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286734  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1214  multidrug efflux system subunit MdtB  26.4 
 
 		 1052 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.243575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  26.55 
 
 		 1060 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1941  acriflavin resistance protein  24.85 
 
 		 1041 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143318  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1042 aa  373  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1856  acriflavin resistance protein  24.85 
 
 		 1041 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 		 1088 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 		 1041 aa  371  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  28.61 
 
 		 1050 aa  373  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2258  acriflavin resistance protein  25.63 
 
 		 1053 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456797  normal  0.166006 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1331  multidrug efflux system subunit MdtB  26.4 
 
 		 1052 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3102  multidrug efflux system subunit MdtB  26.4 
 
 		 1052 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  25.74 
 
 		 1031 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1204  multidrug efflux system subunit MdtC  25.59 
 
 		 1029 aa  369  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.357144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  26.13 
 
 		 1054 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  26.13 
 
 		 1054 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  27.28 
 
 		 1063 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1037 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  26.07 
 
 		 1053 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1037 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2188  acriflavin resistance protein  25.95 
 
 		 1035 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.252865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1039 aa  369  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2831  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1032 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1044 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1059 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2187  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1032 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>