More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0749 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1177  AcrB/AcrD/AcrF family protein  98.31 
 
 		 1005 aa  1946    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0988  integral membrane component of efflux system  64.08 
 
 		 1004 aa  1269    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  39.76 
 
 		 1013 aa  658    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  45.4 
 
 		 1009 aa  794    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0749  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1005 aa  1974    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0686  RND transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) and heavy metal efflux (HME) families, permease protein  46.49 
 
 		 1008 aa  837    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1052  AcrB/AcrD/AcrF family protein  98.01 
 
 		 1005 aa  1943    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 		 1055 aa  507  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1038 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1028 aa  479  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 		 1028 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  29.35 
 
 		 1032 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.51 
 
 		 1496 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 		 1065 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  29.96 
 
 		 1470 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1036 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  29.68 
 
 		 1034 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.49 
 
 		 1050 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1028 aa  439  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 		 1028 aa  439  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  29.23 
 
 		 1047 aa  436  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  30.17 
 
 		 1041 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3554  multidrug efflux system subunit MdtC  27.8 
 
 		 1026 aa  429  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1033 aa  426  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 		 1039 aa  426  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  28.36 
 
 		 1014 aa  424  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  29.18 
 
 		 1045 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  29.48 
 
 		 1038 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1011 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  27.95 
 
 		 1095 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  28.33 
 
 		 1035 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1022 aa  415  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2374  acriflavin resistance protein  28.2 
 
 		 1034 aa  415  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  28.89 
 
 		 1029 aa  416  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1070 aa  416  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4294  acriflavin resistance protein  28.51 
 
 		 1033 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1034 aa  410  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  29.18 
 
 		 1044 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4182  acriflavin resistance protein  28.51 
 
 		 1033 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559486  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.93 
 
 		 1032 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2958  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1029 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451188  normal  0.893752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1037 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1213  multidrug efflux system subunit MdtC  27.4 
 
 		 1024 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1042 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1088 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1330  multidrug efflux system subunit MdtC  27.4 
 
 		 1024 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2704  multidrug efflux system subunit MdtC  27.65 
 
 		 1030 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  28.27 
 
 		 1033 aa  404  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  28.08 
 
 		 1071 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  28.53 
 
 		 1035 aa  404  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2258  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 		 1053 aa  406  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456797  normal  0.166006 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3101  multidrug efflux system subunit MdtC  27.4 
 
 		 1024 aa  405  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0416497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  29.09 
 
 		 1040 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.81 
 
 		 1069 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1044 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1232  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1051 aa  402  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.363088  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  28.61 
 
 		 1088 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1031 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.86 
 
 		 1068 aa  402  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5557  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.39 
 
 		 1032 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130118  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  29.3 
 
 		 1058 aa  398  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  27.22 
 
 		 1055 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  27.06 
 
 		 1048 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1041 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  28.32 
 
 		 1088 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1310  multidrug efflux system subunit MdtC  28.31 
 
 		 1026 aa  395  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1204  multidrug efflux system subunit MdtC  27.6 
 
 		 1029 aa  395  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.357144  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3536  putative component of multidrug efflux pump, mdtB-like protein  27.47 
 
 		 1048 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2968  multidrug efflux system subunit MdtC  28.21 
 
 		 1026 aa  396  1e-108  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  28.44 
 
 		 1075 aa  396  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  29.98 
 
 		 1026 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  29.47 
 
 		 1044 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  27.73 
 
 		 1031 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 		 1039 aa  396  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1041 aa  395  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.26 
 
 		 1063 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 		 1044 aa  393  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1031 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1031 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1032 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  27.87 
 
 		 1031 aa  390  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3300  acriflavin resistance protein  29.68 
 
 		 1108 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.992116  normal  0.412729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 		 1048 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4555  acriflavin resistance protein  28.26 
 
 		 1042 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296261  normal  0.764409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  27.28 
 
 		 1062 aa  388  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3583  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1035 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268046  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.02 
 
 		 1049 aa  384  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.27 
 
 		 1031 aa  386  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  27.45 
 
 		 1031 aa  385  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2375  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1103 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  29.1 
 
 		 1037 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  28.31 
 
 		 1036 aa  384  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2756  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1042 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0866619  normal  0.681611 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1031 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  28.1 
 
 		 1066 aa  386  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3464  Acr family transporter  28.76 
 
 		 1101 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1031 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1031 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3611  acriflavin resistance protein  27.2 
 
 		 1044 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1031 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>