More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0686 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1177  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.49 
 
 		 1005 aa  855    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  44.61 
 
 		 1009 aa  796    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0749  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.49 
 
 		 1005 aa  853    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  38.09 
 
 		 1013 aa  641    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0686  RND transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) and heavy metal efflux (HME) families, permease protein  100 
 
 		 1008 aa  2004    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0988  integral membrane component of efflux system  45.1 
 
 		 1004 aa  837    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1052  AcrB/AcrD/AcrF family protein  46.39 
 
 		 1005 aa  852    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 		 1028 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1028 aa  504  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1055 aa  505  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 		 1058 aa  484  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  30.31 
 
 		 1039 aa  478  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  31.7 
 
 		 1045 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 		 1038 aa  459  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1028 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  30.79 
 
 		 1028 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  30.32 
 
 		 1038 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1095 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.06 
 
 		 1496 aa  452  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1044 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.65 
 
 		 1032 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1011 aa  449  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  28.29 
 
 		 1069 aa  444  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.72 
 
 		 1050 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  29.04 
 
 		 1075 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 		 1036 aa  436  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 		 1029 aa  439  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1047 aa  438  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  28.47 
 
 		 1031 aa  439  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  29.15 
 
 		 1035 aa  433  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  30.2 
 
 		 1026 aa  436  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1034 aa  433  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1071 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  29.03 
 
 		 1037 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  27.77 
 
 		 1041 aa  432  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2258  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 		 1053 aa  432  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456797  normal  0.166006 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2704  multidrug efflux system subunit MdtC  27.87 
 
 		 1030 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  27.2 
 
 		 1033 aa  426  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  27.66 
 
 		 1070 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  29.06 
 
 		 1054 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.83 
 
 		 1039 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  29.8 
 
 		 1050 aa  420  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  29.06 
 
 		 1054 aa  422  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.35 
 
 		 1032 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2968  multidrug efflux system subunit MdtC  28.1 
 
 		 1026 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  27.81 
 
 		 1037 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3611  acriflavin resistance protein  28.18 
 
 		 1044 aa  418  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1055 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  30.22 
 
 		 1037 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5577  acriflavin resistance protein  29.14 
 
 		 1037 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.500475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3554  multidrug efflux system subunit MdtC  27.08 
 
 		 1026 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  28.97 
 
 		 1054 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1066 aa  414  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 		 1036 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  28.2 
 
 		 1041 aa  416  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  28.1 
 
 		 1034 aa  413  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1065 aa  416  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.16 
 
 		 1024 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 		 1059 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1034 aa  410  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1310  multidrug efflux system subunit MdtC  27.81 
 
 		 1026 aa  412  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  27.71 
 
 		 1014 aa  411  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  29.05 
 
 		 1040 aa  408  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.79 
 
 		 1024 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.73 
 
 		 1044 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  26.44 
 
 		 1022 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1330  multidrug efflux system subunit MdtC  26.67 
 
 		 1024 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3101  multidrug efflux system subunit MdtC  26.67 
 
 		 1024 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0416497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4294  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 		 1033 aa  406  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.47 
 
 		 1030 aa  406  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 		 1032 aa  405  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1213  multidrug efflux system subunit MdtC  26.67 
 
 		 1024 aa  405  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286734  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  26.07 
 
 		 1031 aa  403  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1787  acriflavin resistance protein  28.83 
 
 		 1044 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.342493 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4182  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 		 1033 aa  406  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  27 
 
 		 1034 aa  405  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 		 1040 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 		 1058 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1311  multidrug efflux system subunit MdtB  27.66 
 
 		 1040 aa  403  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0917699  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1053 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1035 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03143  drug efflux transmembrane protein  28.13 
 
 		 1033 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  27.77 
 
 		 1036 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  28.67 
 
 		 1033 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  27.01 
 
 		 1048 aa  402  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  28.7 
 
 		 1031 aa  399  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1067 aa  399  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  27.35 
 
 		 1055 aa  399  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.42 
 
 		 1036 aa  399  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2374  acriflavin resistance protein  26.88 
 
 		 1034 aa  398  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4555  acriflavin resistance protein  28.1 
 
 		 1042 aa  399  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.296261  normal  0.764409 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2967  multidrug efflux system subunit MdtB  27.63 
 
 		 1040 aa  399  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  27.97 
 
 		 1063 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.66 
 
 		 1031 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 		 1026 aa  396  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1204  multidrug efflux system subunit MdtC  26.97 
 
 		 1029 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.357144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  26.31 
 
 		 1036 aa  396  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  27.29 
 
 		 1041 aa  395  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1035 aa  391  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>