More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05050 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  39.51 
 
 
1050 aa  642    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  44.96 
 
 
1043 aa  846    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  38.89 
 
 
1028 aa  659    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  39.67 
 
 
1046 aa  692    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  36.79 
 
 
1058 aa  639    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  44.14 
 
 
1043 aa  840    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  37.9 
 
 
1044 aa  649    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  41.71 
 
 
1040 aa  793    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.19 
 
 
1024 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  43.74 
 
 
1044 aa  857    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  38.17 
 
 
1041 aa  648    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  46.71 
 
 
1050 aa  893    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  45.06 
 
 
1044 aa  852    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  42.81 
 
 
1034 aa  790    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  38.44 
 
 
1027 aa  672    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  37.57 
 
 
1055 aa  664    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  39.47 
 
 
1023 aa  685    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  36.8 
 
 
1017 aa  644    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  38.04 
 
 
1027 aa  641    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  45.26 
 
 
1034 aa  886    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  37.72 
 
 
1026 aa  650    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1011 aa  2014    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  38.25 
 
 
1024 aa  647    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  37.5 
 
 
1085 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  37.5 
 
 
1085 aa  634  1e-180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  34.99 
 
 
1173 aa  635  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  37.41 
 
 
1085 aa  631  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  34.86 
 
 
1041 aa  626  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  37.31 
 
 
1083 aa  628  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  34.22 
 
 
1038 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  35.61 
 
 
1039 aa  597  1e-169  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  35.23 
 
 
1038 aa  593  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  34.8 
 
 
1470 aa  595  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  34.64 
 
 
1032 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  34.43 
 
 
1041 aa  591  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  33.56 
 
 
1036 aa  588  1e-166  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.5 
 
 
1049 aa  583  1.0000000000000001e-165  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 
1058 aa  584  1.0000000000000001e-165  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 
1095 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 
1053 aa  583  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 
1046 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 
1047 aa  581  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 
1063 aa  580  1e-164  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 
1034 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  32.91 
 
 
1496 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  34.48 
 
 
1041 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 
1040 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  34.39 
 
 
1045 aa  562  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 
1075 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 
1039 aa  560  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  34.6 
 
 
1050 aa  561  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  34.84 
 
 
1083 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 
1048 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  33.17 
 
 
1069 aa  556  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  33.5 
 
 
1028 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  32.04 
 
 
1059 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 
1058 aa  555  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  32.76 
 
 
1028 aa  552  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  34.49 
 
 
1038 aa  552  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  34.05 
 
 
1036 aa  551  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  34.39 
 
 
1044 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  33.83 
 
 
1006 aa  547  1e-154  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  32.57 
 
 
1070 aa  548  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 
1066 aa  546  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  31.64 
 
 
1071 aa  539  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  32.9 
 
 
1028 aa  542  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 
1065 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 
1033 aa  531  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 
1026 aa  525  1e-147  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0140  acriflavine resistance protein  32.08 
 
 
1071 aa  519  1e-146  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 
1055 aa  516  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 
1022 aa  514  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  32 
 
 
1049 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 
1062 aa  512  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  33.5 
 
 
1064 aa  509  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 
1031 aa  510  1e-143  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  32.14 
 
 
1013 aa  511  1e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  30.79 
 
 
1177 aa  509  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 
1028 aa  510  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 
1048 aa  511  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.37 
 
 
1024 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 
1067 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 
1054 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  31 
 
 
1014 aa  506  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0559  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 
1000 aa  501  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0052837  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  33.2 
 
 
1039 aa  499  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.26 
 
 
1054 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 
1064 aa  502  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  32.87 
 
 
1009 aa  501  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  32.48 
 
 
1037 aa  498  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0545  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 
1008 aa  496  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000592729  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  33.72 
 
 
1057 aa  496  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 
1087 aa  494  9.999999999999999e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 
1043 aa  496  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 
1051 aa  490  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 
1046 aa  493  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  32.26 
 
 
1054 aa  492  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 
1051 aa  491  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 
1101 aa  491  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  32.18 
 
 
1069 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>