More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0354 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  61.19 
 
 
1177 aa  1290    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  59.9 
 
 
1171 aa  1296    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1101 aa  2178    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  37.77 
 
 
1055 aa  588  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  35.24 
 
 
1069 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  35.13 
 
 
1496 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  34.75 
 
 
1032 aa  569  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  34.9 
 
 
1039 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  34.54 
 
 
1070 aa  564  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  34.24 
 
 
1075 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  33.96 
 
 
1470 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  33.7 
 
 
1095 aa  553  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  34.33 
 
 
1071 aa  552  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  34.55 
 
 
1038 aa  549  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  34.45 
 
 
1066 aa  543  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  35.91 
 
 
1028 aa  535  1e-150  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  34.27 
 
 
1041 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 
1058 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  31.72 
 
 
1050 aa  535  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 
1034 aa  533  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 
1036 aa  536  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  35.85 
 
 
1028 aa  532  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  36.14 
 
 
1028 aa  529  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 
1039 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  33.92 
 
 
1043 aa  510  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  32.02 
 
 
1036 aa  506  1e-141  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 
1044 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  34.04 
 
 
1045 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  31.94 
 
 
1053 aa  500  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 
1038 aa  501  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 
1055 aa  501  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 
1011 aa  501  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  34.42 
 
 
1044 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  31.1 
 
 
1050 aa  498  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 
1049 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  31.02 
 
 
1058 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  33.27 
 
 
1036 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 
1034 aa  488  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  32.92 
 
 
1065 aa  489  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  31.72 
 
 
1047 aa  486  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.88 
 
 
1024 aa  485  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  34.74 
 
 
1054 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 
1048 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  34.74 
 
 
1054 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 
1063 aa  485  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 
1041 aa  485  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  30.66 
 
 
1059 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  34.19 
 
 
1033 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 
1031 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  34.93 
 
 
1054 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  32.77 
 
 
1048 aa  480  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 
1031 aa  482  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  35.14 
 
 
1028 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  32.54 
 
 
1048 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 
1040 aa  475  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  32.86 
 
 
1028 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  32.7 
 
 
1027 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  31.31 
 
 
1022 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 
1031 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 
1044 aa  467  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  30 
 
 
1044 aa  469  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 
1046 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 
1064 aa  469  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  32.44 
 
 
1037 aa  466  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  33.86 
 
 
1033 aa  465  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  33.86 
 
 
1033 aa  465  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  32.48 
 
 
1044 aa  465  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  31.82 
 
 
1031 aa  465  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  32.68 
 
 
1035 aa  463  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  34.03 
 
 
1067 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 
1058 aa  462  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0466  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 
1031 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0468485  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 
1050 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  32.54 
 
 
1051 aa  459  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  29.27 
 
 
1043 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 
1039 aa  459  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 
1023 aa  459  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  30.92 
 
 
1062 aa  458  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  33.43 
 
 
1405 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 
1046 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  30 
 
 
1040 aa  453  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  30.56 
 
 
1040 aa  453  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4034  acriflavin resistance protein  32.73 
 
 
1037 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3825  acriflavin resistance protein  32.44 
 
 
1036 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 
1058 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0430  acriflavin resistance protein  32.5 
 
 
1031 aa  452  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.31117  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0397  acriflavin resistance protein  32.34 
 
 
1031 aa  452  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.675147 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.85 
 
 
1022 aa  452  1e-125  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 
1042 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 
1088 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4664  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 
1025 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  30.1 
 
 
1073 aa  445  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.1 
 
 
1031 aa  446  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  30.42 
 
 
1040 aa  445  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1374  acriflavin resistance protein  31.63 
 
 
1028 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.244767  decreased coverage  0.0000403817 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  30.89 
 
 
1068 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.31 
 
 
1034 aa  445  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  29.56 
 
 
1034 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  31.22 
 
 
1028 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 
1036 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>