More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2586 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2979  acriflavin resistance protein  67.26 
 
 
1079 aa  1357    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  71.36 
 
 
1087 aa  1505    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1869  cation efflux system protein  64.67 
 
 
1084 aa  1244    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.443113  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3520  acriflavin resistance protein  99.81 
 
 
1061 aa  2093    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2586  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1061 aa  2098    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  71.05 
 
 
1069 aa  1489    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  65.74 
 
 
1070 aa  1348    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  36.83 
 
 
1057 aa  595  1e-168  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.39 
 
 
1011 aa  469  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 
1050 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 
1044 aa  463  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2346  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 
1024 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.322733  hitchhiker  0.00300678 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3831  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 
1024 aa  458  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  30 
 
 
1034 aa  451  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  31.45 
 
 
1043 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  29.7 
 
 
1034 aa  439  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 
1173 aa  438  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  29.58 
 
 
1082 aa  435  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  29.84 
 
 
1087 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  28.84 
 
 
1043 aa  421  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 
1044 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 
1087 aa  422  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  29.86 
 
 
1087 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  29.91 
 
 
1083 aa  421  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  29.19 
 
 
1046 aa  422  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  30.26 
 
 
1053 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  30.05 
 
 
1087 aa  423  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 
1102 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.72 
 
 
1091 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 
1023 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 
1095 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 
1051 aa  416  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.62 
 
 
1081 aa  416  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  29.04 
 
 
1085 aa  416  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 
1040 aa  405  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 
1028 aa  401  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.41 
 
 
1122 aa  401  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 
1026 aa  402  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 
1048 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.07 
 
 
1049 aa  399  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 
1083 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.57 
 
 
1068 aa  395  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  27.57 
 
 
1044 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 
1085 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 
1085 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  29.32 
 
 
1085 aa  393  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  29.04 
 
 
1060 aa  393  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 
1058 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  28.9 
 
 
1044 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.28 
 
 
1496 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  28.95 
 
 
1042 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 
1048 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 
1024 aa  386  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  28.84 
 
 
1050 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 
1017 aa  385  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 
1041 aa  383  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.04 
 
 
1034 aa  381  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  28.79 
 
 
1039 aa  382  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 
1043 aa  379  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 
1071 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  28.95 
 
 
1041 aa  379  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0427  acriflavin resistance protein  29 
 
 
1039 aa  376  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513566  normal  0.0142489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 
1048 aa  376  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 
1042 aa  376  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 
1040 aa  375  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.59 
 
 
1032 aa  376  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 
1027 aa  376  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 
1470 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  28.26 
 
 
1058 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2756  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 
1042 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0866619  normal  0.681611 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 
1038 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  28.48 
 
 
1041 aa  372  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 
1036 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  27.8 
 
 
1051 aa  373  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  28.48 
 
 
1029 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.71 
 
 
1036 aa  368  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 
1022 aa  368  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  28.8 
 
 
1037 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3825  acriflavin resistance protein  29.79 
 
 
1036 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 
1038 aa  366  1e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4318  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 
1041 aa  366  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.329827 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 
1051 aa  365  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 
1027 aa  365  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  28.24 
 
 
1069 aa  365  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.23 
 
 
1024 aa  364  4e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  26.81 
 
 
1063 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3004  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 
1054 aa  363  9e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.969721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 
1055 aa  362  3e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  28.08 
 
 
1036 aa  362  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 
1037 aa  361  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2375  acriflavin resistance protein  27.89 
 
 
1103 aa  360  6e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  28.1 
 
 
1040 aa  360  7e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  27.13 
 
 
1031 aa  358  3.9999999999999996e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.44 
 
 
1024 aa  357  5.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 
1088 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 
1031 aa  357  5.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0557  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  27.72 
 
 
1046 aa  356  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644093  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 
1055 aa  356  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  26.88 
 
 
1040 aa  355  2e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 
1037 aa  356  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>