More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1420 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  37.13 
 
 		 1044 aa  645    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  79.63 
 
 		 1091 aa  1669    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  78.48 
 
 		 1085 aa  1660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00323  RND superfamily protein  42.19 
 
 		 1166 aa  743    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  78.41 
 
 		 1087 aa  1666    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  78.2 
 
 		 1083 aa  1654    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  44.88 
 
 		 1173 aa  893    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  76.87 
 
 		 1082 aa  1647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  36.97 
 
 		 1050 aa  673    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  38.33 
 
 		 1043 aa  644    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  78.98 
 
 		 1102 aa  1679    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  73.31 
 
 		 1095 aa  1572    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  78.67 
 
 		 1085 aa  1663    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  52.71 
 
 		 1122 aa  1092    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2230  acriflavin resistance protein  53.53 
 
 		 1156 aa  1078    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  78.89 
 
 		 1087 aa  1680    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  36.19 
 
 		 1044 aa  653    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  78.99 
 
 		 1087 aa  1680    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  74.63 
 
 		 1083 aa  1614    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  35.43 
 
 		 1034 aa  641    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  37.07 
 
 		 1043 aa  686    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2529  acriflavin resistance protein  42.13 
 
 		 1213 aa  736    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  79.26 
 
 		 1087 aa  1686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  78.11 
 
 		 1085 aa  1663    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1081 aa  2155    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  78.64 
 
 		 1086 aa  1682    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  78.67 
 
 		 1085 aa  1662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  35.44 
 
 		 1040 aa  622  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  33.92 
 
 		 1034 aa  595  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 		 1023 aa  582  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  37.3 
 
 		 1027 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  35.72 
 
 		 1024 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  35.58 
 
 		 1017 aa  570  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  33.88 
 
 		 1046 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  32.58 
 
 		 1038 aa  542  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  31.37 
 
 		 1044 aa  537  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  36.09 
 
 		 1027 aa  538  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1055 aa  536  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.93 
 
 		 1024 aa  530  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  31.11 
 
 		 1038 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 		 1058 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  34.15 
 
 		 1026 aa  508  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  32.97 
 
 		 1050 aa  506  1e-141  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.32 
 
 		 1049 aa  499  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 		 1032 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  31.09 
 
 		 1470 aa  502  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1041 aa  495  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1041 aa  491  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1062 aa  489  1e-137  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1069 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 		 1071 aa  486  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  30.88 
 
 		 1039 aa  486  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  30.42 
 
 		 1496 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  30.4 
 
 		 1041 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 		 1028 aa  476  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1051 aa  475  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1053 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  31.37 
 
 		 1028 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.94 
 
 		 1022 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.53 
 
 		 1024 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  30.22 
 
 		 1041 aa  465  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1095 aa  465  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  31.34 
 
 		 1028 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 		 1039 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  29.88 
 
 		 1040 aa  460  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  30.94 
 
 		 1101 aa  460  9.999999999999999e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  30.61 
 
 		 1069 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1048 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  29.84 
 
 		 1070 aa  462  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  29.44 
 
 		 1036 aa  458  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  28.79 
 
 		 1058 aa  454  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  29.26 
 
 		 1036 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  28.9 
 
 		 1087 aa  452  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 		 1059 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  30.71 
 
 		 1070 aa  451  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 		 1006 aa  451  1e-125  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 		 1171 aa  446  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.04 
 
 		 1034 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  30.06 
 
 		 1029 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1869  cation efflux system protein  33.21 
 
 		 1084 aa  441  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.443113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  30.09 
 
 		 1026 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2979  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 		 1079 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1034 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 		 1065 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  31.22 
 
 		 1057 aa  440  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1046 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 		 1048 aa  437  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1042 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1063 aa  439  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  29.6 
 
 		 1014 aa  438  1e-121  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  30.15 
 
 		 1031 aa  439  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 		 1058 aa  438  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  30.6 
 
 		 1031 aa  437  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2381  acriflavin resistance protein D  30.44 
 
 		 1092 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.422424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0835  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1042 aa  434  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181435  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  29.99 
 
 		 1030 aa  436  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  29.58 
 
 		 1075 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  29.69 
 
 		 1033 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  30.51 
 
 		 1038 aa  435  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 		 1047 aa  432  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>