More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2359 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1028 aa  2012    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  37 
 
 		 1044 aa  658    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  40.27 
 
 		 1050 aa  689    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  47.25 
 
 		 1024 aa  800    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  54.17 
 
 		 1027 aa  983    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  37.27 
 
 		 1034 aa  655    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  38.89 
 
 		 1011 aa  724    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  38.97 
 
 		 1044 aa  644    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  48.25 
 
 		 1027 aa  829    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  39.09 
 
 		 1034 aa  689    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  47.72 
 
 		 1017 aa  848    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  64.2 
 
 		 1026 aa  1247    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  35.93 
 
 		 1043 aa  633  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  36.3 
 
 		 1040 aa  613  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  39.14 
 
 		 1043 aa  610  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1044 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.27 
 
 		 1049 aa  572  1e-161  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  34.26 
 
 		 1023 aa  569  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  35.27 
 
 		 1496 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  35.08 
 
 		 1470 aa  566  1e-160  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35 
 
 		 1024 aa  568  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  34 
 
 		 1046 aa  568  1e-160  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  35.91 
 
 		 1041 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  34.87 
 
 		 1034 aa  560  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  33.69 
 
 		 1038 aa  553  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  33.83 
 
 		 1041 aa  554  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  34.4 
 
 		 1036 aa  555  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  34.56 
 
 		 1065 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1032 aa  548  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  34.75 
 
 		 1086 aa  547  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  33.98 
 
 		 1039 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  34.31 
 
 		 1102 aa  547  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.83 
 
 		 1081 aa  546  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.65 
 
 		 1091 aa  543  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  35.21 
 
 		 1083 aa  544  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  34.57 
 
 		 1085 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  31.56 
 
 		 1058 aa  545  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  34.84 
 
 		 1085 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  34.67 
 
 		 1041 aa  539  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  34.89 
 
 		 1071 aa  542  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  33.58 
 
 		 1095 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  34.47 
 
 		 1085 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  34.38 
 
 		 1085 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  34.53 
 
 		 1087 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  34.99 
 
 		 1087 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1055 aa  536  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  31.66 
 
 		 1059 aa  539  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  34.91 
 
 		 1039 aa  538  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  35.12 
 
 		 1087 aa  539  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1070 aa  533  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  35.58 
 
 		 1028 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  34.2 
 
 		 1087 aa  532  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1173 aa  527  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  33.8 
 
 		 1083 aa  528  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  33.55 
 
 		 1095 aa  525  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  35.8 
 
 		 1045 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  34.43 
 
 		 1040 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1006 aa  520  1e-146  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1075 aa  519  1e-146  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  34.89 
 
 		 1028 aa  519  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  34.81 
 
 		 1050 aa  517  1.0000000000000001e-145  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  32.22 
 
 		 1044 aa  519  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  33.84 
 
 		 1069 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  35.99 
 
 		 1044 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  34.77 
 
 		 1028 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.73 
 
 		 1122 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  30.4 
 
 		 1058 aa  509  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  33.91 
 
 		 1036 aa  513  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  35.67 
 
 		 1038 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  32.8 
 
 		 1062 aa  503  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  33.4 
 
 		 1066 aa  501  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  32.66 
 
 		 1026 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1029 aa  499  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1063 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  33.87 
 
 		 1046 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 		 1058 aa  498  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1038 aa  499  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  32.18 
 
 		 1041 aa  497  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  31.18 
 
 		 1050 aa  499  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 		 1047 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.91 
 
 		 1024 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1051 aa  490  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  31.86 
 
 		 1053 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1067 aa  487  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1054 aa  489  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1054 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  34.46 
 
 		 1037 aa  483  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1054 aa  486  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  32.44 
 
 		 1043 aa  484  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 		 1014 aa  483  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  35.01 
 
 		 1028 aa  482  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 		 1055 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0882  acriflavin resistance protein  35.25 
 
 		 1057 aa  480  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  30.19 
 
 		 1040 aa  478  1e-133  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  31.76 
 
 		 1049 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  31.5 
 
 		 1048 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1048 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 		 1064 aa  476  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  32.63 
 
 		 1033 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  31.92 
 
 		 1031 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>