More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4494 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  50.92 
 
 		 1039 aa  982    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  47.87 
 
 		 1034 aa  975    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  47.4 
 
 		 1036 aa  939    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  45.91 
 
 		 1055 aa  908    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  45.78 
 
 		 1048 aa  882    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  49.46 
 
 		 1059 aa  1006    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1049 aa  2108    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  49.46 
 
 		 1050 aa  967    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  54.72 
 
 		 1040 aa  1073    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  46.73 
 
 		 1058 aa  920    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  46.45 
 
 		 1053 aa  917    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  45.92 
 
 		 1058 aa  904    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  47.85 
 
 		 1046 aa  892    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  50 
 
 		 1063 aa  991    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  46.81 
 
 		 1041 aa  932    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  35.3 
 
 		 1050 aa  626  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  35.15 
 
 		 1034 aa  623  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  34.27 
 
 		 1058 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  33.89 
 
 		 1038 aa  587  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.57 
 
 		 1043 aa  565  1.0000000000000001e-159  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 		 1011 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  33.27 
 
 		 1496 aa  560  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1055 aa  562  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  33.02 
 
 		 1071 aa  559  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.91 
 
 		 1024 aa  558  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 		 1028 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 		 1043 aa  553  1e-156  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1028 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1028 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 		 1039 aa  551  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1032 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 		 1470 aa  546  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  31.94 
 
 		 1044 aa  548  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  32.67 
 
 		 1036 aa  544  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1041 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.98 
 
 		 1049 aa  526  1e-148  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  31.56 
 
 		 1044 aa  527  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 		 1101 aa  523  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 		 1065 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  31.53 
 
 		 1070 aa  523  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 		 1095 aa  520  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  32.43 
 
 		 1047 aa  519  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1028 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 		 1026 aa  513  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  31.76 
 
 		 1022 aa  513  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  31.29 
 
 		 1069 aa  509  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  31.83 
 
 		 1051 aa  512  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1048 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1045 aa  512  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1054 aa  512  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1042 aa  508  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.89 
 
 		 1054 aa  509  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1038 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1023 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  30.48 
 
 		 1034 aa  507  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  30.67 
 
 		 1046 aa  508  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  32.89 
 
 		 1054 aa  505  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.37 
 
 		 1024 aa  502  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 		 1038 aa  502  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  31.36 
 
 		 1035 aa  501  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1075 aa  497  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  31.07 
 
 		 1044 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1033 aa  498  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  31.29 
 
 		 1009 aa  499  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  30.42 
 
 		 1035 aa  495  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  30.74 
 
 		 1040 aa  492  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 		 1017 aa  490  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  31.01 
 
 		 1066 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  30.88 
 
 		 1036 aa  487  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  31.45 
 
 		 1036 aa  487  1e-136  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1026 aa  489  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1031 aa  483  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  30.89 
 
 		 1031 aa  483  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2399  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1032 aa  484  1e-135  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.774253  normal  0.772443 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  32.26 
 
 		 1027 aa  485  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  30.75 
 
 		 1027 aa  485  1e-135  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 		 1044 aa  482  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 		 1031 aa  480  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1062 aa  480  1e-134  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  31.54 
 
 		 1024 aa  482  1e-134  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  30.95 
 
 		 1031 aa  482  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1042 aa  476  1e-133  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  29.32 
 
 		 1013 aa  478  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  30.55 
 
 		 1046 aa  479  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2354  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 		 1027 aa  474  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 		 1067 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4170  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 		 1171 aa  474  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00460578  normal  0.0104573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 		 1044 aa  475  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1033 aa  475  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1033 aa  475  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4303  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1177 aa  474  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763591  normal  0.628382 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 		 1088 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1048 aa  476  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  28.67 
 
 		 1030 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  29.47 
 
 		 1064 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  30.31 
 
 		 1088 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1031 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  30.44 
 
 		 1050 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  30.09 
 
 		 1058 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  30.39 
 
 		 1040 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>