More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2193 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  77.09 
 
 		 1082 aa  1662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  78.68 
 
 		 1085 aa  1671    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  78.47 
 
 		 1091 aa  1643    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  74.84 
 
 		 1102 aa  1630    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  77.78 
 
 		 1083 aa  1654    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01076  AcrB/AcrD/AcrF family protein  52.42 
 
 		 1122 aa  1080    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  43.66 
 
 		 1173 aa  885    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  77.54 
 
 		 1086 aa  1657    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  78.86 
 
 		 1085 aa  1674    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  36.31 
 
 		 1050 aa  654    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  78.77 
 
 		 1085 aa  1674    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2529  acriflavin resistance protein  41.16 
 
 		 1213 aa  745    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2193  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1095 aa  2196    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  35.01 
 
 		 1043 aa  637    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  78.49 
 
 		 1085 aa  1666    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  73.31 
 
 		 1081 aa  1565    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2230  acriflavin resistance protein  52.8 
 
 		 1156 aa  1080    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  78.35 
 
 		 1087 aa  1660    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  78.35 
 
 		 1087 aa  1658    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  82.34 
 
 		 1083 aa  1768    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  78.53 
 
 		 1087 aa  1661    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00323  RND superfamily protein  41.14 
 
 		 1166 aa  738    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  76.82 
 
 		 1087 aa  1639    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  34.11 
 
 		 1034 aa  621  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  33.89 
 
 		 1044 aa  612  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  35.97 
 
 		 1043 aa  609  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  36.36 
 
 		 1044 aa  606  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  33.8 
 
 		 1040 aa  592  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  32.24 
 
 		 1034 aa  576  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  32.85 
 
 		 1046 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.85 
 
 		 1055 aa  559  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  35.11 
 
 		 1027 aa  544  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 		 1041 aa  508  9.999999999999999e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  30.87 
 
 		 1038 aa  506  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 		 1058 aa  493  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1032 aa  485  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 		 1039 aa  486  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  33.61 
 
 		 1028 aa  482  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  32.28 
 
 		 1026 aa  481  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  30.32 
 
 		 1071 aa  479  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2232  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1069 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.977365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 		 1087 aa  458  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  28.74 
 
 		 1041 aa  450  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  29.28 
 
 		 1039 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1046  acriflavin resistance protein  31.11 
 
 		 1070 aa  446  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00124975  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  29.45 
 
 		 1036 aa  448  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  29.13 
 
 		 1051 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 		 1028 aa  446  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  29.33 
 
 		 1034 aa  446  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.18 
 
 		 1022 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1095 aa  443  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  30.15 
 
 		 1075 aa  439  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  29.69 
 
 		 1029 aa  435  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2381  acriflavin resistance protein D  29.01 
 
 		 1092 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.422424  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  29.07 
 
 		 1065 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  28.66 
 
 		 1053 aa  435  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.99 
 
 		 1063 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1026 aa  428  1e-118  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  29.95 
 
 		 1046 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 		 1070 aa  426  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  29 
 
 		 1047 aa  426  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 		 1033 aa  426  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1101 aa  425  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1869  cation efflux system protein  32.13 
 
 		 1084 aa  425  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.443113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  28.94 
 
 		 1037 aa  426  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  31.44 
 
 		 1038 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1034 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1058 aa  423  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1014 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  29.46 
 
 		 1041 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1045 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 		 1073 aa  419  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1059 aa  419  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1037 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2979  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1079 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  28.62 
 
 		 1031 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  28.49 
 
 		 1058 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.29 
 
 		 1068 aa  418  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0835  acriflavin resistance protein  29.4 
 
 		 1042 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.181435  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.13 
 
 		 1024 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  27.35 
 
 		 1009 aa  416  1e-114  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3520  acriflavin resistance protein  29.65 
 
 		 1061 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  29.19 
 
 		 1066 aa  416  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  27.55 
 
 		 1030 aa  414  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  27.99 
 
 		 1048 aa  415  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  28 
 
 		 1496 aa  412  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2586  acriflavin resistance protein  29.65 
 
 		 1061 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  28.46 
 
 		 1069 aa  412  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 		 1027 aa  412  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1029 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  27.69 
 
 		 1050 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1044 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1031 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  28.66 
 
 		 1064 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.22 
 
 		 1034 aa  405  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  27.84 
 
 		 1051 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1023 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  27.94 
 
 		 1051 aa  402  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 		 1054 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1036 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>