More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0030 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1027 aa  2056    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.95 
 
 
1055 aa  546  1e-154  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 
1038 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  34.04 
 
 
1496 aa  535  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  32.01 
 
 
1050 aa  532  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 
1028 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  33.76 
 
 
1028 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 
1032 aa  524  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  33.79 
 
 
1041 aa  522  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  32.28 
 
 
1036 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 
1039 aa  510  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 
1039 aa  511  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  32.9 
 
 
1028 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 
1470 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 
1063 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  30.99 
 
 
1095 aa  497  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  30.58 
 
 
1070 aa  495  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.42 
 
 
1024 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  30.78 
 
 
1050 aa  493  9.999999999999999e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  32.28 
 
 
1058 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 
1058 aa  489  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 
1071 aa  487  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  33.97 
 
 
1028 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 
1034 aa  488  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  29.38 
 
 
1011 aa  485  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  31.03 
 
 
1044 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  29.62 
 
 
1034 aa  473  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  29.41 
 
 
1044 aa  475  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  31.48 
 
 
1075 aa  469  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 
1040 aa  469  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 
1065 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.93 
 
 
1059 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.73 
 
 
1053 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  29.57 
 
 
1041 aa  464  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  29.19 
 
 
1058 aa  464  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  29.59 
 
 
1069 aa  463  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 
1073 aa  461  9.999999999999999e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  31.27 
 
 
1047 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 
1043 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  30.2 
 
 
1036 aa  458  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 
1055 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  30.17 
 
 
1066 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 
1034 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 
1033 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.46 
 
 
1024 aa  450  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 
1067 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  30.56 
 
 
1049 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 
1022 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 
1062 aa  442  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  31.15 
 
 
1028 aa  438  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5577  acriflavin resistance protein  28.77 
 
 
1037 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.500475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  29.06 
 
 
1048 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 
1038 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  29.68 
 
 
1029 aa  436  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 
1051 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  31.56 
 
 
1045 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 
1040 aa  432  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  31.42 
 
 
1031 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 
1006 aa  430  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  29.86 
 
 
1022 aa  432  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  28.21 
 
 
1068 aa  429  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 
1014 aa  429  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  30.11 
 
 
1031 aa  429  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 
1046 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.43 
 
 
1049 aa  425  1e-117  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 
1048 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 
1043 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 
1044 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  30.69 
 
 
1405 aa  421  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 
1035 aa  422  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  30.04 
 
 
1041 aa  422  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  30.26 
 
 
1042 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  29.99 
 
 
1048 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 
1064 aa  422  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 
1009 aa  420  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 
1046 aa  418  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 
1038 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 
1026 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  29.11 
 
 
1051 aa  418  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 
1017 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2378  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 
1044 aa  415  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.856569  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 
1054 aa  413  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 
1054 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  29.43 
 
 
1031 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  30.39 
 
 
1031 aa  412  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  27.93 
 
 
1026 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  27.7 
 
 
1035 aa  410  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 
1054 aa  412  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  29.58 
 
 
1024 aa  412  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 
1018 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  31.03 
 
 
1028 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  28.05 
 
 
1031 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 
1034 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 
1031 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  28.26 
 
 
1034 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 
1031 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.12 
 
 
1081 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 
1033 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  27.89 
 
 
1030 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 
1031 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>