More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1876 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1017 aa  1955    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  37.1 
 
 		 1011 aa  669    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  38.36 
 
 		 1050 aa  677    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  53.17 
 
 		 1027 aa  932    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  49.26 
 
 		 1024 aa  833    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  47.37 
 
 		 1028 aa  812    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  63.72 
 
 		 1027 aa  1121    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  36.7 
 
 		 1034 aa  636    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  45.36 
 
 		 1026 aa  791    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  36.22 
 
 		 1044 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  39.94 
 
 		 1043 aa  629  1e-178  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  36.99 
 
 		 1040 aa  628  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  36.24 
 
 		 1034 aa  624  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  34.65 
 
 		 1043 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  36.74 
 
 		 1044 aa  602  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.61 
 
 		 1081 aa  572  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  35.26 
 
 		 1102 aa  561  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 		 1023 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.11 
 
 		 1091 aa  556  1e-157  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  34.77 
 
 		 1082 aa  559  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  34.99 
 
 		 1086 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  35.64 
 
 		 1085 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.63 
 
 		 1024 aa  553  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  34.86 
 
 		 1087 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  35.18 
 
 		 1085 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  34.95 
 
 		 1087 aa  553  1e-156  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  34.24 
 
 		 1470 aa  549  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.05 
 
 		 1049 aa  549  1e-155  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  35.55 
 
 		 1085 aa  551  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1087 aa  551  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  35.55 
 
 		 1085 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  34.53 
 
 		 1087 aa  551  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  34.53 
 
 		 1083 aa  547  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  32.52 
 
 		 1044 aa  548  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 		 1046 aa  547  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  34.41 
 
 		 1083 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 		 1038 aa  538  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 		 1173 aa  525  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  33.07 
 
 		 1496 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1036 aa  519  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  34.45 
 
 		 1055 aa  518  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1058 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  31.49 
 
 		 1032 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 		 1029 aa  511  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  35.91 
 
 		 1038 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  30.86 
 
 		 1041 aa  509  1e-143  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  36.63 
 
 		 1045 aa  511  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  32.01 
 
 		 1038 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  34.93 
 
 		 1039 aa  509  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  36.93 
 
 		 1044 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  32.56 
 
 		 1065 aa  503  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  35.75 
 
 		 1028 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  32.56 
 
 		 1041 aa  500  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 		 1053 aa  496  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  35.75 
 
 		 1028 aa  497  1e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 		 1058 aa  494  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  29.83 
 
 		 1063 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1058 aa  486  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1039 aa  488  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 		 1070 aa  486  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 		 1071 aa  481  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  31.76 
 
 		 1050 aa  479  1e-134  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  32.24 
 
 		 1041 aa  481  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  31.19 
 
 		 1009 aa  477  1e-133  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  33.47 
 
 		 1028 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 		 1041 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 		 1047 aa  475  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  30.28 
 
 		 1034 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 		 1014 aa  467  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1040 aa  467  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  32.6 
 
 		 1069 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  30.73 
 
 		 1006 aa  463  1e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  30.08 
 
 		 1026 aa  462  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 		 1022 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1054 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1054 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1054 aa  458  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.45 
 
 		 1059 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  31.92 
 
 		 1046 aa  458  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1033 aa  457  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  32.26 
 
 		 1048 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1037 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  30.52 
 
 		 1049 aa  456  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  29.73 
 
 		 1095 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  32.92 
 
 		 1067 aa  455  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1062 aa  454  1.0000000000000001e-126  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 		 1048 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1031 aa  451  1e-125  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  31.94 
 
 		 1035 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1037 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  28.9 
 
 		 1037 aa  451  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.41 
 
 		 1034 aa  452  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.11 
 
 		 1024 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  30.73 
 
 		 1030 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  29.26 
 
 		 1050 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  30.62 
 
 		 1035 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1638  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1026 aa  448  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.643434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  30.24 
 
 		 1022 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  35.21 
 
 		 1028 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0304  acriflavin resistance protein  33.6 
 
 		 1028 aa  446  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.99394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>