More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0304 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  42.23 
 
 		 1051 aa  811    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  72.67 
 
 		 1029 aa  1377    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0304  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1028 aa  1996    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.99394  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1034 aa  510  1e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1132  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 		 1034 aa  504  1e-141  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1043 aa  501  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0572  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 		 1033 aa  494  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000015454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  35.12 
 
 		 1043 aa  492  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0522  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1032 aa  486  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.302221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  30.48 
 
 		 1050 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  31.06 
 
 		 1058 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  29.79 
 
 		 1011 aa  465  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  31.32 
 
 		 1470 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  30.48 
 
 		 1496 aa  459  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1071 aa  459  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1034 aa  459  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1063 aa  459  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1032 aa  456  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  33.1 
 
 		 1017 aa  459  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  30.43 
 
 		 1058 aa  455  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1023 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  33.07 
 
 		 1055 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  29.06 
 
 		 1044 aa  452  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  29.93 
 
 		 1044 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1058 aa  449  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  34.51 
 
 		 1027 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 		 1053 aa  443  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  29.31 
 
 		 1034 aa  441  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  30.18 
 
 		 1039 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  29.98 
 
 		 1041 aa  439  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  30.52 
 
 		 1075 aa  435  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  29.33 
 
 		 1095 aa  435  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  30.31 
 
 		 1041 aa  434  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 		 1044 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 		 1024 aa  431  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  31.81 
 
 		 1036 aa  430  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1036 aa  432  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  33.14 
 
 		 1054 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  27.82 
 
 		 1006 aa  432  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 		 1033 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.9 
 
 		 1039 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  29.24 
 
 		 1040 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1054 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  28.9 
 
 		 1048 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  33.04 
 
 		 1054 aa  428  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  29.13 
 
 		 1038 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  31.51 
 
 		 1031 aa  422  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1066 aa  420  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 		 1065 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  31.41 
 
 		 1031 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  31.56 
 
 		 1049 aa  418  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  27.04 
 
 		 1046 aa  419  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  30.21 
 
 		 1069 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0459  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 		 1027 aa  415  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  30.15 
 
 		 1036 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  30.77 
 
 		 1035 aa  413  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.21 
 
 		 1024 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1059 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 		 1070 aa  412  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  31.63 
 
 		 1067 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.97 
 
 		 1081 aa  404  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.36 
 
 		 1049 aa  400  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4104  acriflavin resistance protein  29.97 
 
 		 1031 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1044 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1031 aa  402  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.66 
 
 		 1024 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  31.53 
 
 		 1045 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  27.56 
 
 		 1050 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  31.04 
 
 		 1026 aa  397  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  29.3 
 
 		 1022 aa  394  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5613  acriflavin resistance protein  29.33 
 
 		 1050 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 		 1033 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 		 1033 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  30.13 
 
 		 1048 aa  395  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2359  acriflavin resistance protein  32.2 
 
 		 1028 aa  396  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995142  normal  0.101465 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  31.1 
 
 		 1028 aa  393  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.59 
 
 		 1040 aa  392  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 		 1028 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  27.16 
 
 		 1055 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  32.21 
 
 		 1044 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4664  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 		 1025 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1028 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  29.18 
 
 		 1043 aa  390  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  30.42 
 
 		 1405 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  31.3 
 
 		 1038 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 		 1062 aa  390  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0652  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 		 1027 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.653108  normal  0.0388492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1034 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1027 aa  389  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  29.9 
 
 		 1024 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1046 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1083 aa  389  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  29.11 
 
 		 1035 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  30.41 
 
 		 1048 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2022  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 		 1041 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  28.9 
 
 		 1060 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  29.28 
 
 		 1050 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  28.77 
 
 		 1022 aa  385  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  29.52 
 
 		 1072 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  30.48 
 
 		 1088 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>