More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0527 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6163  hypothetical protein  44.07 
 
 		 1028 aa  743    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367103  hitchhiker  0.000303541 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  61.16 
 
 		 1064 aa  1166    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  47.39 
 
 		 1065 aa  855    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07530  cation/multidrug efflux pump  46.76 
 
 		 1062 aa  788    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.417061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4438  hypothetical protein  48.71 
 
 		 1089 aa  864    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0339173  hitchhiker  0.00783982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2548  acriflavin resistance protein  47.39 
 
 		 1028 aa  713    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0919  acriflavin resistance protein  46.93 
 
 		 1040 aa  729    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16282  normal  0.511424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  45.97 
 
 		 1074 aa  870    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  42.26 
 
 		 1075 aa  719    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08430  heavy metal efflux pump, cobalt-zinc-cadmium  42.98 
 
 		 1077 aa  707    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.295378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3454  acriflavin resistance protein  44.02 
 
 		 1089 aa  749    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  0.0107739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3649  acriflavin resistance protein  45.56 
 
 		 1104 aa  786    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4031  acriflavin resistance protein  46.76 
 
 		 1097 aa  783    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  41.86 
 
 		 1072 aa  721    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02800  cation/multidrug efflux pump  44.21 
 
 		 1121 aa  736    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1067 aa  2100    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  34.3 
 
 		 1050 aa  530  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1016 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5229  acriflavin resistance protein  33.87 
 
 		 1038 aa  516  1e-144  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1015 aa  512  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5289  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.62 
 
 		 1038 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5114  transporter; acriflavin resistance protein  33.52 
 
 		 1038 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5131  transporter; acriflavin resistance protein  33.52 
 
 		 1038 aa  509  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5686  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.62 
 
 		 1038 aa  511  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5560  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  33.74 
 
 		 1038 aa  509  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5530  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  33.62 
 
 		 1038 aa  510  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5616  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  33.43 
 
 		 1038 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5389  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  33.65 
 
 		 1038 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.433954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  32.62 
 
 		 1011 aa  508  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5568  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.27 
 
 		 1039 aa  503  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  31.7 
 
 		 1044 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3953  acriflavin resistance protein  32.99 
 
 		 1039 aa  498  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  33.36 
 
 		 1043 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4317  acriflavin resistance protein  39.5 
 
 		 1263 aa  488  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31.25 
 
 		 1043 aa  486  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1843  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.72 
 
 		 1051 aa  485  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0542827  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2328  acriflavin resistance protein  30.45 
 
 		 1055 aa  485  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2287  acriflavin resistance protein  30.45 
 
 		 1055 aa  485  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 		 1034 aa  478  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  30.48 
 
 		 1023 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1418  integral membrane efflux protein  30.39 
 
 		 1004 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.133612  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.33 
 
 		 1053 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  30.85 
 
 		 1044 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  30.85 
 
 		 1034 aa  453  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0685  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.96 
 
 		 1014 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0629  acriflavin resistance protein  27.96 
 
 		 1014 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0719  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.96 
 
 		 1014 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0606  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1014 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0459502  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  27.08 
 
 		 1014 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 		 1063 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1048 aa  445  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0847  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  27.77 
 
 		 1014 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000146243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  29.96 
 
 		 1059 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0629  acriflavin resistance protein  27.78 
 
 		 1014 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0312217  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  29.12 
 
 		 1034 aa  438  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  29.32 
 
 		 1041 aa  431  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  30.85 
 
 		 1036 aa  430  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.45 
 
 		 1496 aa  429  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4583  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  27.2 
 
 		 980 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0441702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0788  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.59 
 
 		 1014 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  30.39 
 
 		 1040 aa  426  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  30.22 
 
 		 1046 aa  423  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0774  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  28.07 
 
 		 955 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66679e-17 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  30.36 
 
 		 1051 aa  421  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  28.01 
 
 		 1058 aa  423  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 1035 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  27.92 
 
 		 1050 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  28.69 
 
 		 1055 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 		 1055 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  29.56 
 
 		 1065 aa  413  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  29.18 
 
 		 1041 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1039 aa  409  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  29.91 
 
 		 1040 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 		 1039 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  27.67 
 
 		 1058 aa  405  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.77 
 
 		 1032 aa  406  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  28.67 
 
 		 1470 aa  404  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  30.18 
 
 		 1028 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1038 aa  403  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1046 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 		 1070 aa  400  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  28.41 
 
 		 1069 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.09 
 
 		 1049 aa  395  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  30.71 
 
 		 1027 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  30.01 
 
 		 1028 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 		 1095 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3373  acriflavin resistance protein  30.8 
 
 		 1031 aa  395  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.306386  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  27.39 
 
 		 1044 aa  394  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4023  acriflavin resistance protein  30.7 
 
 		 1031 aa  396  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.349324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  28.07 
 
 		 1041 aa  389  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  31.59 
 
 		 1033 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  27.06 
 
 		 1038 aa  389  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.2 
 
 		 1024 aa  386  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  30.22 
 
 		 1033 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 		 1022 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 		 1014 aa  385  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  30.22 
 
 		 1033 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1058 aa  383  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 		 1075 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  28.04 
 
 		 1041 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>