More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1784 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07530  cation/multidrug efflux pump  49.48 
 
 		 1062 aa  867    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.417061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  47.5 
 
 		 1067 aa  846    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08430  heavy metal efflux pump, cobalt-zinc-cadmium  44.08 
 
 		 1077 aa  734    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.295378  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  52.5 
 
 		 1064 aa  965    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3649  acriflavin resistance protein  57.13 
 
 		 1104 aa  1027    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2548  acriflavin resistance protein  56.89 
 
 		 1028 aa  914    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02800  cation/multidrug efflux pump  43.51 
 
 		 1121 aa  752    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  58.5 
 
 		 1074 aa  1187    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4438  hypothetical protein  65.69 
 
 		 1089 aa  1286    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0339173  hitchhiker  0.00783982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4031  acriflavin resistance protein  58.62 
 
 		 1097 aa  1010    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115859 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  48 
 
 		 1072 aa  889    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3454  acriflavin resistance protein  48.25 
 
 		 1089 aa  840    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  0.0107739 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1065 aa  2090    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  49.01 
 
 		 1075 aa  885    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0919  acriflavin resistance protein  49.66 
 
 		 1040 aa  833    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16282  normal  0.511424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6163  hypothetical protein  49.34 
 
 		 1028 aa  871    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367103  hitchhiker  0.000303541 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  36.47 
 
 		 1015 aa  570  1e-161  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  35.59 
 
 		 1016 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1034 aa  528  1e-148  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  34.16 
 
 		 1050 aa  517  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 		 1023 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 		 1043 aa  511  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 		 1011 aa  503  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5389  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  33.3 
 
 		 1038 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.433954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1418  integral membrane efflux protein  32.29 
 
 		 1004 aa  502  1e-140  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.133612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  32.67 
 
 		 1044 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2328  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1055 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2287  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1055 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5289  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.46 
 
 		 1038 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5114  transporter; acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1038 aa  496  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5131  transporter; acriflavin resistance protein  33.37 
 
 		 1038 aa  496  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5686  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.46 
 
 		 1038 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5560  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  33.27 
 
 		 1038 aa  498  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5229  acriflavin resistance protein  32.89 
 
 		 1038 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5568  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.33 
 
 		 1039 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1843  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.08 
 
 		 1051 aa  490  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0542827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5530  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  33.27 
 
 		 1038 aa  492  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5616  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  33.27 
 
 		 1038 aa  492  1e-137  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4317  acriflavin resistance protein  38.9 
 
 		 1263 aa  484  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0685  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  32.39 
 
 		 1014 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0629  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 		 1014 aa  476  1e-133  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0719  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  32.39 
 
 		 1014 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  32.7 
 
 		 1044 aa  478  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3953  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 		 1039 aa  475  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0847  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.92 
 
 		 1014 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000146243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.54 
 
 		 1014 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0629  acriflavin resistance protein  31.84 
 
 		 1014 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0312217  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  33.68 
 
 		 1043 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1039 aa  458  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0788  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.3 
 
 		 1014 aa  457  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  31.24 
 
 		 1055 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  29.27 
 
 		 1053 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0606  acriflavin resistance protein  29.91 
 
 		 1014 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0459502  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  30.7 
 
 		 1040 aa  449  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4583  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  32.06 
 
 		 980 aa  451  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0441702 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.19 
 
 		 1049 aa  448  1.0000000000000001e-124  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  30.36 
 
 		 1050 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  31.81 
 
 		 1039 aa  449  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  29.56 
 
 		 1041 aa  446  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0774  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  32.57 
 
 		 955 aa  445  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66679e-17 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  29.74 
 
 		 1048 aa  443  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  29.7 
 
 		 1496 aa  439  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1071 aa  439  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1034 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  29.15 
 
 		 1470 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 		 1041 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  30.57 
 
 		 1065 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.97 
 
 		 1024 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 		 1046 aa  432  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  28.79 
 
 		 1069 aa  430  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.45 
 
 		 1063 aa  428  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 		 1027 aa  429  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  29.66 
 
 		 1041 aa  425  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  27.72 
 
 		 1032 aa  424  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1051 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28.84 
 
 		 1059 aa  423  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1041 aa  420  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  28.47 
 
 		 1058 aa  422  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 		 1044 aa  419  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 		 1034 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1087 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 		 1087 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  27.99 
 
 		 1070 aa  414  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  30.7 
 
 		 1028 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  26.13 
 
 		 1038 aa  410  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.63 
 
 		 1091 aa  412  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2523  acriflavin resistance protein  31.21 
 
 		 1026 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199891 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 		 1087 aa  411  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 		 1017 aa  412  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  28.67 
 
 		 1055 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  30.7 
 
 		 1028 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  29.87 
 
 		 1036 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1058 aa  408  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  29.7 
 
 		 1040 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2410  acriflavin resistance protein  30.8 
 
 		 1036 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904497  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1075 aa  405  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1083 aa  404  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5613  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 		 1050 aa  406  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1048 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 		 1067 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>