More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0948 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1015 aa  2033    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5289  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  38.57 
 
 
1038 aa  638    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5114  transporter; acriflavin resistance protein  38.57 
 
 
1038 aa  638    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5131  transporter; acriflavin resistance protein  38.38 
 
 
1038 aa  636    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5686  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  38.57 
 
 
1038 aa  638    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  73.62 
 
 
1016 aa  1526    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5229  acriflavin resistance protein  38.58 
 
 
1038 aa  635  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5560  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  38.51 
 
 
1038 aa  633  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5389  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  38.61 
 
 
1038 aa  635  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.433954  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5616  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  38.42 
 
 
1038 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5530  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  38.48 
 
 
1038 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5568  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  38.1 
 
 
1039 aa  629  1e-178  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3953  acriflavin resistance protein  38.23 
 
 
1039 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2328  acriflavin resistance protein  34 
 
 
1055 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2287  acriflavin resistance protein  34 
 
 
1055 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  34.28 
 
 
1014 aa  536  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0685  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  34.61 
 
 
1014 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257038  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0629  acriflavin resistance protein  34.51 
 
 
1014 aa  534  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0719  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  34.61 
 
 
1014 aa  533  1e-150  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  34.83 
 
 
1074 aa  535  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0629  acriflavin resistance protein  34.58 
 
 
1014 aa  528  1e-148  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0312217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0847  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  34.48 
 
 
1014 aa  529  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000146243  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  36.18 
 
 
1065 aa  528  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0788  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  34.58 
 
 
1014 aa  524  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1843  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.62 
 
 
1051 aa  521  1e-146  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0542827  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0606  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 
1014 aa  505  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0459502  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  34.53 
 
 
1064 aa  504  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4438  hypothetical protein  33.36 
 
 
1089 aa  500  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0339173  hitchhiker  0.00783982 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07530  cation/multidrug efflux pump  34.69 
 
 
1062 aa  502  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.417061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3649  acriflavin resistance protein  34.36 
 
 
1104 aa  495  9.999999999999999e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3454  acriflavin resistance protein  34.3 
 
 
1089 aa  496  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  0.0107739 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4583  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  33.54 
 
 
980 aa  490  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0441702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 
1067 aa  491  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6163  hypothetical protein  33.86 
 
 
1028 aa  486  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367103  hitchhiker  0.000303541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  32 
 
 
1072 aa  487  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0774  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  33.99 
 
 
955 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66679e-17 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08430  heavy metal efflux pump, cobalt-zinc-cadmium  33.49 
 
 
1077 aa  476  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.295378  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  32.41 
 
 
1075 aa  479  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 
1044 aa  473  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  32.62 
 
 
1023 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4031  acriflavin resistance protein  34.26 
 
 
1097 aa  467  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00115859 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  30.67 
 
 
1050 aa  465  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  30.89 
 
 
1034 aa  458  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02800  cation/multidrug efflux pump  32.13 
 
 
1121 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4317  acriflavin resistance protein  37.43 
 
 
1263 aa  451  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0919  acriflavin resistance protein  32.29 
 
 
1040 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16282  normal  0.511424 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 
1044 aa  446  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 
1011 aa  439  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  30.38 
 
 
1043 aa  435  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1418  integral membrane efflux protein  30.33 
 
 
1004 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.133612  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  31.17 
 
 
1039 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2548  acriflavin resistance protein  32.31 
 
 
1028 aa  417  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  29.68 
 
 
1040 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  30.99 
 
 
1043 aa  414  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  29.92 
 
 
1063 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 
1040 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 
1034 aa  399  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 
1058 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  29.33 
 
 
1036 aa  394  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.44 
 
 
1024 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  30.1 
 
 
1041 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 
1053 aa  393  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 
1039 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  30.1 
 
 
1055 aa  390  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 
1041 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  29.06 
 
 
1050 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  28.01 
 
 
1058 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 
1086 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0140  acriflavine resistance protein  30.52 
 
 
1071 aa  380  1e-104  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  28.45 
 
 
1055 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  30.55 
 
 
1087 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2515  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 
1085 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0795793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4494  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 
1049 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.45729 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.64 
 
 
1091 aa  374  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 
1038 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1829  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 
1085 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00817457  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  30.54 
 
 
1085 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  27.89 
 
 
1059 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 
1034 aa  375  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 
1087 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  30.46 
 
 
1087 aa  375  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.66 
 
 
1081 aa  375  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2522  acriflavin resistance protein  30.44 
 
 
1085 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2276  acriflavin resistance protein  30.52 
 
 
1083 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.440839  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 
1038 aa  372  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  27.85 
 
 
1046 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 
1082 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  30.26 
 
 
1087 aa  372  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  29.58 
 
 
1027 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  28.79 
 
 
1054 aa  365  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  28.07 
 
 
1069 aa  361  4e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 
1054 aa  360  5e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 
1054 aa  360  6e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 
1048 aa  360  7e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  29.91 
 
 
1102 aa  358  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2544  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 
1087 aa  357  7.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694393  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.49 
 
 
1017 aa  357  7.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  27.77 
 
 
1101 aa  356  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  28.61 
 
 
1028 aa  356  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  28.64 
 
 
1013 aa  355  2e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>