More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07530 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  48.55 
 
 		 1064 aa  818    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  46.4 
 
 		 1067 aa  784    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0919  acriflavin resistance protein  50.96 
 
 		 1040 aa  810    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.16282  normal  0.511424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  47.67 
 
 		 1074 aa  880    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2548  acriflavin resistance protein  50.78 
 
 		 1028 aa  758    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2287  acriflavin resistance protein  48.23 
 
 		 1075 aa  853    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00014609 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02800  cation/multidrug efflux pump  44.41 
 
 		 1121 aa  731    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07530  cation/multidrug efflux pump  100 
 
 		 1062 aa  2048    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.417061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3454  acriflavin resistance protein  47.2 
 
 		 1089 aa  794    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  0.0107739 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3649  acriflavin resistance protein  51.66 
 
 		 1104 aa  852    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1784  acriflavin resistance protein  49.11 
 
 		 1065 aa  865    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4438  hypothetical protein  49.91 
 
 		 1089 aa  875    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0339173  hitchhiker  0.00783982 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2550  acriflavin resistance protein  48.45 
 
 		 1072 aa  861    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6163  hypothetical protein  47.73 
 
 		 1028 aa  741    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367103  hitchhiker  0.000303541 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08430  heavy metal efflux pump, cobalt-zinc-cadmium  46.39 
 
 		 1077 aa  724    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.295378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4031  acriflavin resistance protein  51.19 
 
 		 1097 aa  832    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115859 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  34.82 
 
 		 1015 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2503  acriflavin resistance protein  33.92 
 
 		 1016 aa  535  1e-150  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000075994  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1418  integral membrane efflux protein  33.65 
 
 		 1004 aa  515  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.133612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5560  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  33.97 
 
 		 1038 aa  511  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5229  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 		 1038 aa  511  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5389  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  33.4 
 
 		 1038 aa  512  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.433954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5616  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  33.59 
 
 		 1038 aa  505  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5289  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.3 
 
 		 1038 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5114  transporter; acriflavin resistance protein  33.59 
 
 		 1038 aa  504  1e-141  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5131  transporter; acriflavin resistance protein  33.21 
 
 		 1038 aa  503  1e-141  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5686  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.3 
 
 		 1038 aa  504  1e-141  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5568  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  33.08 
 
 		 1039 aa  500  1e-140  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5530  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  33.4 
 
 		 1038 aa  498  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3953  acriflavin resistance protein  33.18 
 
 		 1039 aa  496  9.999999999999999e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  31.43 
 
 		 1023 aa  486  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.55 
 
 		 1011 aa  488  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  33.05 
 
 		 1050 aa  483  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 		 1044 aa  486  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0754  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  31.38 
 
 		 1014 aa  482  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  32.02 
 
 		 1034 aa  481  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2287  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1055 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2328  acriflavin resistance protein  30.93 
 
 		 1055 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1843  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.01 
 
 		 1051 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0542827  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  31.41 
 
 		 1058 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0629  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1014 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4317  acriflavin resistance protein  40.28 
 
 		 1263 aa  470  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  31 
 
 		 1043 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0685  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.14 
 
 		 1014 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.257038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0719  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.14 
 
 		 1014 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.296873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0606  acriflavin resistance protein  30.52 
 
 		 1014 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0459502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0788  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  31.27 
 
 		 1014 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0629  acriflavin resistance protein  30.98 
 
 		 1014 aa  459  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0312217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0847  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  30.75 
 
 		 1014 aa  459  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000146243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4583  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  30.53 
 
 		 980 aa  451  1e-125  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0441702 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  31.08 
 
 		 1044 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 		 1039 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  33.78 
 
 		 1043 aa  439  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  30.06 
 
 		 1053 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0774  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  30.53 
 
 		 955 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.66679e-17 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1063 aa  419  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  29.3 
 
 		 1055 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 		 1040 aa  415  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  28.01 
 
 		 1058 aa  413  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  30.14 
 
 		 1050 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  29.49 
 
 		 1034 aa  406  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 		 1173 aa  405  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.34 
 
 		 1049 aa  401  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  31.83 
 
 		 1027 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  28.49 
 
 		 1048 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1059 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  29.93 
 
 		 1036 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.79 
 
 		 1024 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  29.86 
 
 		 1034 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1038 aa  389  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  30.1 
 
 		 1041 aa  388  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  29.8 
 
 		 1040 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  30.59 
 
 		 1031 aa  385  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  31.48 
 
 		 1045 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  30 
 
 		 1039 aa  383  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1038 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1470 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2827  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 		 1041 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 		 1046 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  31.11 
 
 		 1028 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  27.44 
 
 		 1058 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1350  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1024 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0568344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  30.16 
 
 		 1055 aa  372  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1048 aa  372  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 		 1028 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1044 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0545  acriflavin resistance protein  29.62 
 
 		 1008 aa  367  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000592729  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0559  acriflavin resistance protein  29.82 
 
 		 1000 aa  369  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0052837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 		 1044 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  28.06 
 
 		 1041 aa  363  9e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  30.07 
 
 		 1017 aa  362  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  28.4 
 
 		 1046 aa  362  2e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 		 1029 aa  361  4e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  26.95 
 
 		 1006 aa  359  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  27.79 
 
 		 1044 aa  359  1.9999999999999998e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  29.59 
 
 		 1051 aa  355  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1095 aa  355  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  31.33 
 
 		 1067 aa  354  4e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  26.06 
 
 		 1014 aa  354  5e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  27.16 
 
 		 1070 aa  354  5.9999999999999994e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>