More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1215 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  33.9 
 
 
1143 aa  639    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  33.95 
 
 
1191 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  44.2 
 
 
1043 aa  855    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1092 aa  2210    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  34.84 
 
 
1124 aa  638    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  35.14 
 
 
1165 aa  633  1e-180  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  34.08 
 
 
1146 aa  634  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  34.24 
 
 
1134 aa  629  1e-179  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  34.62 
 
 
1057 aa  614  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  34.55 
 
 
1069 aa  601  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.52 
 
 
1052 aa  596  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1679  acriflavin resistance protein  35.12 
 
 
1048 aa  597  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.906292  normal  0.699127 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  35.25 
 
 
1045 aa  598  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2742  acriflavin resistance protein  36.05 
 
 
1041 aa  592  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  35.31 
 
 
1042 aa  572  1e-161  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  35.21 
 
 
1034 aa  568  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  35.12 
 
 
1044 aa  565  1.0000000000000001e-159  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  33.86 
 
 
1038 aa  553  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  32.4 
 
 
1024 aa  550  1e-155  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  34.06 
 
 
1033 aa  548  1e-154  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  34.58 
 
 
1039 aa  543  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  29.85 
 
 
1044 aa  488  1e-136  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 
1050 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  30.65 
 
 
1011 aa  478  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  30.05 
 
 
1043 aa  473  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2625  acriflavin resistance protein  31.61 
 
 
1067 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  28.47 
 
 
1034 aa  462  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  29.74 
 
 
1044 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.26 
 
 
1049 aa  454  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.32 
 
 
1024 aa  456  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.98 
 
 
1032 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 
1043 aa  450  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  29.08 
 
 
1033 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 
1038 aa  445  1e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  45.38 
 
 
1290 aa  444  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0192  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.97 
 
 
1025 aa  443  9.999999999999999e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.958952  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 
1040 aa  437  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 
1034 aa  433  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  28.44 
 
 
1038 aa  429  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  29.6 
 
 
1034 aa  427  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 
1041 aa  423  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 
1006 aa  414  1e-114  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 
1023 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.67 
 
 
1036 aa  410  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  27.21 
 
 
1058 aa  412  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  28.34 
 
 
1039 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  27.53 
 
 
1020 aa  412  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  27.37 
 
 
1046 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 
1014 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  28.62 
 
 
1028 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  28.44 
 
 
1028 aa  405  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  29.43 
 
 
1039 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 
1020 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  28.29 
 
 
1038 aa  402  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 
1065 aa  398  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  27.48 
 
 
1028 aa  399  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 
1026 aa  399  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0641  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 
1041 aa  394  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  26.94 
 
 
1063 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  28.48 
 
 
1074 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  28.38 
 
 
1017 aa  390  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 
1173 aa  388  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1025  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 
1050 aa  388  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.67 
 
 
1041 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 
1058 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 
1047 aa  386  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 
1030 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  26.12 
 
 
1053 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 
1027 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 
1040 aa  383  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  26.12 
 
 
1058 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  28.85 
 
 
1039 aa  380  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 
1063 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.89 
 
 
1027 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.49 
 
 
1067 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  27.46 
 
 
1121 aa  379  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  28.16 
 
 
1028 aa  380  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  27.22 
 
 
1052 aa  380  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 
1063 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 
1063 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 
1029 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  26.33 
 
 
1031 aa  379  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 
1063 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  28.21 
 
 
1073 aa  379  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 
1046 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 
1063 aa  376  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  27.34 
 
 
1071 aa  376  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 
1034 aa  375  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  26.28 
 
 
1042 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 
1022 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 
1035 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  26.64 
 
 
1031 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 
1031 aa  372  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  26.55 
 
 
1031 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 
1031 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 
1067 aa  373  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  26.64 
 
 
1031 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 
1031 aa  372  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 
1067 aa  370  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 
1031 aa  372  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>