More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1057 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  59.45 
 
 		 1030 aa  1183    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  41.79 
 
 		 1036 aa  779    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  42.06 
 
 		 1033 aa  791    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  38.09 
 
 		 1041 aa  770    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  39.43 
 
 		 1063 aa  757    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1035 aa  2047    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  40.23 
 
 		 1041 aa  788    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  40.69 
 
 		 1034 aa  759    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  44.48 
 
 		 1033 aa  862    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  41.35 
 
 		 1035 aa  785    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  33.24 
 
 		 1052 aa  551  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  34.49 
 
 		 1074 aa  541  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  35.38 
 
 		 1040 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  29.26 
 
 		 1067 aa  520  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  29.17 
 
 		 1067 aa  522  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 		 1063 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  28.82 
 
 		 1063 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1063 aa  516  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  28.92 
 
 		 1063 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 		 1067 aa  513  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1063 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  29.44 
 
 		 1048 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.5 
 
 		 1067 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1043 aa  498  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  31.36 
 
 		 1032 aa  486  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.87 
 
 		 1041 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1038 aa  480  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1049 aa  478  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  28.43 
 
 		 1050 aa  478  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  33.02 
 
 		 1050 aa  476  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1121 aa  469  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  28.19 
 
 		 1055 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  27.92 
 
 		 1044 aa  466  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.34 
 
 		 1067 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  30.27 
 
 		 1054 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  30.84 
 
 		 1034 aa  462  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  27.87 
 
 		 1053 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  32.52 
 
 		 1053 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  32.32 
 
 		 1051 aa  454  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  27.66 
 
 		 1054 aa  452  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  31.58 
 
 		 1064 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1053 aa  445  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  30.21 
 
 		 1033 aa  437  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  28.92 
 
 		 1039 aa  435  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  27.92 
 
 		 1071 aa  431  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  31.82 
 
 		 1075 aa  430  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  28.91 
 
 		 1048 aa  425  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  28.15 
 
 		 1056 aa  422  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  28.09 
 
 		 1048 aa  419  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  27.99 
 
 		 1042 aa  419  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  28.13 
 
 		 1073 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  26.81 
 
 		 1060 aa  415  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1072 aa  413  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  28.02 
 
 		 1060 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  27.32 
 
 		 1057 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1060 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  26.56 
 
 		 1053 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  26.96 
 
 		 1068 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1061 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.15 
 
 		 1054 aa  398  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 		 1041 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.42 
 
 		 1093 aa  396  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  26.12 
 
 		 1069 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.3 
 
 		 1074 aa  388  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1062 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  26.62 
 
 		 1053 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  27.57 
 
 		 1098 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  25.95 
 
 		 1050 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1052 aa  376  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1035 aa  363  6e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  26.06 
 
 		 1066 aa  355  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  28.45 
 
 		 1030 aa  351  5e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.09 
 
 		 1060 aa  345  2e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 		 1034 aa  336  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1044 aa  331  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.93 
 
 		 1036 aa  324  6e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1030 aa  323  9.000000000000001e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  26.27 
 
 		 1031 aa  320  7e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  26.27 
 
 		 1031 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 		 1031 aa  319  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  24.9 
 
 		 1063 aa  318  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1044 aa  317  7e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  26.19 
 
 		 1165 aa  315  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.96 
 
 		 1034 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  26.53 
 
 		 1031 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  26.1 
 
 		 1034 aa  313  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  25.93 
 
 		 1031 aa  313  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  26.53 
 
 		 1031 aa  313  1e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  26.53 
 
 		 1031 aa  313  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1043 aa  313  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.47 
 
 		 1041 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1031 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  29.08 
 
 		 1025 aa  309  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.88 
 
 		 1031 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1993  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 		 1025 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  24.04 
 
 		 1058 aa  303  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  25.31 
 
 		 1038 aa  303  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1031 aa  303  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1032 aa  301  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  23.86 
 
 		 1011 aa  301  6e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>