More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3934 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  36.39 
 
 		 1053 aa  693    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  61.71 
 
 		 1034 aa  1268    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.34 
 
 		 1060 aa  682    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.21 
 
 		 1041 aa  673    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  35.69 
 
 		 1060 aa  642    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.62 
 
 		 1067 aa  722    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  35.43 
 
 		 1057 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  36.61 
 
 		 1063 aa  710    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  36.64 
 
 		 1049 aa  692    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  42.3 
 
 		 1032 aa  840    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  42.1 
 
 		 1052 aa  792    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  36.35 
 
 		 1063 aa  708    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  36.4 
 
 		 1055 aa  691    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.8 
 
 		 1067 aa  681    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  35.12 
 
 		 1073 aa  644    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  36.46 
 
 		 1039 aa  641    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  100 
 
 		 1042 aa  2114    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  36.78 
 
 		 1048 aa  725    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  35.58 
 
 		 1060 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  36.35 
 
 		 1063 aa  709    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  43.85 
 
 		 1038 aa  825    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  36.95 
 
 		 1067 aa  713    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  35.43 
 
 		 1044 aa  640    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  36.93 
 
 		 1067 aa  715    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  36.88 
 
 		 1050 aa  701    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  41.18 
 
 		 1121 aa  799    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  38.21 
 
 		 1051 aa  679    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  36.55 
 
 		 1067 aa  708    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  36.45 
 
 		 1063 aa  711    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  36.45 
 
 		 1063 aa  713    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  34.66 
 
 		 1061 aa  622  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.35 
 
 		 1074 aa  616  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  35.87 
 
 		 1060 aa  600  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.64 
 
 		 1054 aa  584  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1069 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.49 
 
 		 1093 aa  582  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  34.66 
 
 		 1075 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  33.24 
 
 		 1056 aa  563  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  33.01 
 
 		 1050 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  32.62 
 
 		 1052 aa  551  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1053 aa  550  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  32 
 
 		 1054 aa  543  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  33.49 
 
 		 1050 aa  540  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  32.05 
 
 		 1062 aa  530  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  32.94 
 
 		 1041 aa  530  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  31.9 
 
 		 1074 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  32.16 
 
 		 1068 aa  525  1e-147  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  33.74 
 
 		 1098 aa  521  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  31.54 
 
 		 1071 aa  509  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  31.73 
 
 		 1040 aa  502  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  31.94 
 
 		 1066 aa  497  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1072 aa  497  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  29.74 
 
 		 1041 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1033 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  30.31 
 
 		 1033 aa  495  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  31.47 
 
 		 1053 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  32 
 
 		 1043 aa  492  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1064 aa  485  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1053 aa  477  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1035 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  30.02 
 
 		 1030 aa  474  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1033 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  29.76 
 
 		 1036 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  29.65 
 
 		 1034 aa  469  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  29.15 
 
 		 1041 aa  466  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  28.35 
 
 		 1054 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  28.91 
 
 		 1048 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  28.15 
 
 		 1053 aa  438  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 		 1063 aa  434  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  27.8 
 
 		 1048 aa  425  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  28.09 
 
 		 1035 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  28.83 
 
 		 1035 aa  399  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 		 1030 aa  393  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  29.79 
 
 		 1131 aa  392  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  30.97 
 
 		 1135 aa  386  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1050 aa  331  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  29.39 
 
 		 1137 aa  327  7e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.82 
 
 		 1043 aa  324  6e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 		 1044 aa  320  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  25.22 
 
 		 1046 aa  317  6e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  25.88 
 
 		 1055 aa  317  7e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  26.1 
 
 		 1043 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.93 
 
 		 1043 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1056 aa  310  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  25.34 
 
 		 1044 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1057 aa  307  9.000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  24.24 
 
 		 1191 aa  304  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 		 1034 aa  301  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 		 1064 aa  300  8e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  24.21 
 
 		 1038 aa  298  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  26.39 
 
 		 1075 aa  296  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  25.32 
 
 		 1011 aa  295  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  26.59 
 
 		 1042 aa  295  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  25.12 
 
 		 1005 aa  289  2e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1025 aa  288  5e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  24.38 
 
 		 1039 aa  287  7e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  24.62 
 
 		 1069 aa  286  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.9 
 
 		 1034 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1034 aa  284  5.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  24.38 
 
 		 1034 aa  284  7.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>