More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1402 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1030 aa  2059    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  84.57 
 
 		 1035 aa  1734    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  33.21 
 
 		 1057 aa  548  1e-154  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  32.7 
 
 		 1056 aa  543  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  32.79 
 
 		 1064 aa  544  1e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 		 1033 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  29.96 
 
 		 1121 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.21 
 
 		 1067 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 		 1050 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1048 aa  435  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 		 1067 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  29.38 
 
 		 1067 aa  435  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  28.93 
 
 		 1063 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  28.72 
 
 		 1063 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 		 1063 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  28.72 
 
 		 1063 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1067 aa  432  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  28.72 
 
 		 1063 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  28.9 
 
 		 1042 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  27.88 
 
 		 1041 aa  421  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  28.26 
 
 		 1055 aa  420  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  28.11 
 
 		 1053 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  29.32 
 
 		 1034 aa  418  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  28.21 
 
 		 1036 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.74 
 
 		 1067 aa  416  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  28.86 
 
 		 1032 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  29.62 
 
 		 1049 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1050 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.64 
 
 		 1074 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1993  acriflavin resistance protein  29.97 
 
 		 1025 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  28.18 
 
 		 1039 aa  405  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  28.2 
 
 		 1063 aa  404  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  28.09 
 
 		 1035 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  29.55 
 
 		 1053 aa  399  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.17 
 
 		 1041 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  28.41 
 
 		 1060 aa  399  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  29.32 
 
 		 1025 aa  399  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1033 aa  395  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  28.84 
 
 		 1060 aa  395  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  28.64 
 
 		 1071 aa  393  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1057 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  28.47 
 
 		 1011 aa  392  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  28.97 
 
 		 1034 aa  392  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  29.09 
 
 		 1052 aa  393  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1038 aa  392  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  28.23 
 
 		 1041 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 		 1073 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  29.74 
 
 		 1048 aa  389  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  28.21 
 
 		 1044 aa  389  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1061 aa  389  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  28.87 
 
 		 1060 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  28.65 
 
 		 1092 aa  385  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  28.74 
 
 		 1043 aa  385  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 		 1043 aa  383  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1146 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  27.38 
 
 		 1041 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 		 1143 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  28.93 
 
 		 1048 aa  379  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  28.49 
 
 		 1034 aa  379  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  28.17 
 
 		 1069 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  28.38 
 
 		 1056 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  27.75 
 
 		 1030 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  25.89 
 
 		 1044 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1034 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  28.2 
 
 		 1033 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1054 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.63 
 
 		 1093 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.82 
 
 		 1044 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  27.48 
 
 		 1050 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1052 aa  363  7.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  28.6 
 
 		 1035 aa  357  6.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  26.57 
 
 		 1074 aa  356  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.8 
 
 		 1024 aa  352  2e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1054 aa  352  3e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  27.06 
 
 		 1053 aa  350  6e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 		 1040 aa  347  6e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1095 aa  347  7e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1053 aa  347  7e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.73 
 
 		 1058 aa  347  8e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  26.07 
 
 		 1040 aa  347  1e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1066 aa  346  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  27.2 
 
 		 1075 aa  346  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1563  cation/multidrug efflux pump-like  30.16 
 
 		 1055 aa  345  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.974109  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  25.25 
 
 		 1134 aa  345  4e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 		 1034 aa  344  5.999999999999999e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1050 aa  344  5.999999999999999e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  25.46 
 
 		 1043 aa  342  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.92 
 
 		 1054 aa  342  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  27.2 
 
 		 1051 aa  341  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1028 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1044 aa  339  9.999999999999999e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  26.1 
 
 		 1059 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 		 1041 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1058 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  24.17 
 
 		 1044 aa  337  5e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  25.4 
 
 		 1062 aa  337  7.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.86 
 
 		 1036 aa  336  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1055 aa  333  8e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  26.59 
 
 		 1069 aa  332  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.92 
 
 		 1060 aa  331  4e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>