More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02660 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  47.3 
 
 		 1073 aa  988    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  49.28 
 
 		 1074 aa  996    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.88 
 
 		 1041 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.5 
 
 		 1067 aa  873    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  45.55 
 
 		 1048 aa  909    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  100 
 
 		 1056 aa  2141    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  44.68 
 
 		 1063 aa  886    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  43.66 
 
 		 1044 aa  827    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  44.97 
 
 		 1063 aa  882    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.67 
 
 		 1093 aa  874    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  47.36 
 
 		 1060 aa  954    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  46.85 
 
 		 1060 aa  975    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  47.44 
 
 		 1057 aa  979    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  73.74 
 
 		 1069 aa  1543    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  44.11 
 
 		 1055 aa  880    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  44.69 
 
 		 1067 aa  880    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  44.55 
 
 		 1067 aa  881    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  44.75 
 
 		 1050 aa  868    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  47.29 
 
 		 1061 aa  977    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  67.18 
 
 		 1050 aa  1442    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  44.77 
 
 		 1053 aa  878    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  44.78 
 
 		 1063 aa  888    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  45.47 
 
 		 1049 aa  882    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  44.36 
 
 		 1067 aa  878    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  47.73 
 
 		 1060 aa  991    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  44.83 
 
 		 1067 aa  861    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  67.37 
 
 		 1052 aa  1453    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  44.78 
 
 		 1063 aa  889    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  44.88 
 
 		 1063 aa  890    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  35.64 
 
 		 1052 aa  635  1e-180  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  35.95 
 
 		 1039 aa  626  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  35.17 
 
 		 1121 aa  619  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  35.93 
 
 		 1072 aa  589  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  33.53 
 
 		 1068 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  32.88 
 
 		 1053 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  33.84 
 
 		 1062 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  35.66 
 
 		 1038 aa  568  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1032 aa  553  1e-156  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  33.27 
 
 		 1042 aa  554  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  34.12 
 
 		 1051 aa  546  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  31.72 
 
 		 1066 aa  521  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  34.56 
 
 		 1034 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1098 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  29.67 
 
 		 1041 aa  498  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  32.08 
 
 		 1075 aa  484  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  31.94 
 
 		 1071 aa  481  1e-134  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  31.2 
 
 		 1041 aa  478  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  30.77 
 
 		 1033 aa  479  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  31.44 
 
 		 1053 aa  479  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.8 
 
 		 1060 aa  473  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  30.5 
 
 		 1053 aa  473  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  30.78 
 
 		 1035 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1054 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  30.05 
 
 		 1040 aa  471  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  31.46 
 
 		 1048 aa  469  9.999999999999999e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  30.43 
 
 		 1034 aa  464  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  30.12 
 
 		 1036 aa  466  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  30.69 
 
 		 1053 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.55 
 
 		 1054 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 		 1054 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  29.64 
 
 		 1033 aa  456  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  30.23 
 
 		 1033 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 		 1048 aa  451  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  29.34 
 
 		 1043 aa  453  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  28.22 
 
 		 1074 aa  452  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  28.42 
 
 		 1041 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  28.1 
 
 		 1030 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1050 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1063 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1064 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  28.22 
 
 		 1035 aa  410  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  28.3 
 
 		 1030 aa  351  3e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  28.04 
 
 		 1035 aa  340  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  27.04 
 
 		 1131 aa  338  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  26.39 
 
 		 1135 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.06 
 
 		 1044 aa  308  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1043 aa  289  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  25.97 
 
 		 1137 aa  288  5e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  24.24 
 
 		 1038 aa  288  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  25.65 
 
 		 1025 aa  287  7e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  25.24 
 
 		 1005 aa  287  7e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  26.55 
 
 		 1058 aa  287  9e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  25.38 
 
 		 1095 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  24.95 
 
 		 1055 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  25.32 
 
 		 1070 aa  286  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  24.69 
 
 		 1046 aa  286  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1063 aa  284  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.41 
 
 		 1031 aa  282  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1031 aa  282  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1031 aa  283  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1031 aa  281  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 1496 aa  280  9e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  24.8 
 
 		 1191 aa  280  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  24.73 
 
 		 1050 aa  279  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1036 aa  277  6e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  24.73 
 
 		 1143 aa  277  9e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  25.51 
 
 		 1031 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 		 1031 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  25.41 
 
 		 1031 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  24.63 
 
 		 1050 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>