More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1635 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01595  RND family efflux transporter  45.33 
 
 		 1071 aa  887    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  66.22 
 
 		 1048 aa  1387    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  63.39 
 
 		 1048 aa  1359    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  74.28 
 
 		 1053 aa  1541    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1054 aa  2112    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  34.9 
 
 		 1052 aa  592  1e-167  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.33 
 
 		 1067 aa  581  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  32.33 
 
 		 1063 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  32.66 
 
 		 1121 aa  569  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1067 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1067 aa  567  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  32.62 
 
 		 1055 aa  567  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  31.87 
 
 		 1063 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 		 1067 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  31.87 
 
 		 1063 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1048 aa  561  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 		 1063 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  31.87 
 
 		 1063 aa  562  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 		 1053 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  31.74 
 
 		 1049 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  31.52 
 
 		 1050 aa  551  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.58 
 
 		 1067 aa  550  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.14 
 
 		 1041 aa  548  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  32.4 
 
 		 1032 aa  548  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  32.04 
 
 		 1044 aa  544  1e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  33.77 
 
 		 1039 aa  542  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1035 aa  529  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  30.81 
 
 		 1041 aa  526  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  31.92 
 
 		 1060 aa  521  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  31.26 
 
 		 1060 aa  522  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.68 
 
 		 1074 aa  519  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1929  acriflavin resistance protein  31.16 
 
 		 1061 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.323076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  31.46 
 
 		 1033 aa  518  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  31.6 
 
 		 1073 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  30.96 
 
 		 1057 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1033 aa  509  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  32.93 
 
 		 1038 aa  501  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  31.21 
 
 		 1050 aa  503  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 		 1053 aa  502  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  30.83 
 
 		 1060 aa  498  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  30.17 
 
 		 1036 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  30.78 
 
 		 1052 aa  491  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3901  acriflavin resistance protein  30.08 
 
 		 1041 aa  490  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.26 
 
 		 1093 aa  486  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  28.5 
 
 		 1063 aa  484  1e-135  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  30.09 
 
 		 1034 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 		 1041 aa  483  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  28.53 
 
 		 1066 aa  481  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  30.22 
 
 		 1056 aa  478  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  30.06 
 
 		 1053 aa  479  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3036  efflux transporter  31.27 
 
 		 1075 aa  477  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.199533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  29.56 
 
 		 1069 aa  478  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3597  acriflavin resistance protein  29.61 
 
 		 1068 aa  478  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.335598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  29.58 
 
 		 1062 aa  478  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  30.7 
 
 		 1074 aa  476  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0475  acriflavin resistance protein  31.23 
 
 		 1072 aa  469  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.505165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  28.63 
 
 		 1030 aa  465  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  30.17 
 
 		 1034 aa  460  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  29.3 
 
 		 1051 aa  462  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  31.13 
 
 		 1033 aa  449  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.59 
 
 		 1054 aa  443  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 		 1043 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  28.35 
 
 		 1042 aa  446  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  27.66 
 
 		 1035 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 		 1050 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  30.35 
 
 		 1053 aa  433  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  29.09 
 
 		 1040 aa  428  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  29.87 
 
 		 1064 aa  413  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  29.53 
 
 		 1054 aa  412  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.6 
 
 		 1060 aa  396  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1842  acriflavin resistance protein  27.58 
 
 		 1098 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  28.28 
 
 		 1011 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1030 aa  354  5e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3898  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1131 aa  350  8e-95  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.377402 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1050 aa  347  7e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  28.64 
 
 		 1035 aa  343  9e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.05 
 
 		 1044 aa  341  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1043 aa  341  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  28.56 
 
 		 1025 aa  337  5e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  27.69 
 
 		 1043 aa  337  5.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3066  acriflavin resistance protein  27.46 
 
 		 1137 aa  335  2e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  26.27 
 
 		 1044 aa  333  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 		 1092 aa  330  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1028 aa  329  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 		 1034 aa  328  3e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 		 1028 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3081  efflux transporter  28.6 
 
 		 1135 aa  325  3e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00863053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.59 
 
 		 1046 aa  317  7e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.25 
 
 		 1024 aa  314  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.04 
 
 		 1049 aa  307  7e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  25.64 
 
 		 1165 aa  306  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  25.86 
 
 		 1055 aa  305  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  24.42 
 
 		 1039 aa  301  4e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  25.3 
 
 		 1039 aa  301  5e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  24.77 
 
 		 1191 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  25.03 
 
 		 1040 aa  298  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  26.49 
 
 		 1043 aa  295  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  26.07 
 
 		 1038 aa  295  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  24.98 
 
 		 1051 aa  295  4e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.12 
 
 		 1470 aa  294  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>