More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0799 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0270  acriflavin resistance protein  35.09 
 
 		 1039 aa  652    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.384793  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0799  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1044 aa  2083    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1499  resistance-nodulation-cell division family transporter  39.72 
 
 		 1005 aa  738    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  27.7 
 
 		 1033 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3188  acriflavin resistance protein  26.42 
 
 		 1033 aa  356  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.53306  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3565  acriflavin resistance protein  25.99 
 
 		 1036 aa  350  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.909012  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0945  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.26 
 
 		 1067 aa  350  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1074 aa  348  4e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  25.38 
 
 		 1067 aa  347  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3235  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1067 aa  346  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.890283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0243  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1054 aa  345  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0292102  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0788  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1067 aa  343  8e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 		 1063 aa  343  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1063 aa  342  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3648  acriflavin resistance protein  25.53 
 
 		 1063 aa  342  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1756  acriflavin resistance protein  27.3 
 
 		 1041 aa  341  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06541  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1033 aa  340  5.9999999999999996e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2206  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1063 aa  340  8e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.577957  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  25.43 
 
 		 1063 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  25.53 
 
 		 1048 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0838  acriflavin resistance protein  25.34 
 
 		 1063 aa  338  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.64825  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  25.58 
 
 		 1050 aa  337  5e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0308  acriflavin resistance protein  23.66 
 
 		 1050 aa  336  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.514616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  27.14 
 
 		 1052 aa  335  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2915  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1035 aa  334  4e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0258  acriflavin resistance protein  25.14 
 
 		 1040 aa  334  5e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.359322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1568  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1043 aa  331  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.888167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  26.92 
 
 		 1034 aa  331  5.0000000000000004e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1055 aa  320  6e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  25.07 
 
 		 1041 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  24.95 
 
 		 1049 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.75 
 
 		 1041 aa  318  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1733  acriflavin resistance protein  25.41 
 
 		 1064 aa  318  5e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373856  normal  0.683525 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2936  acriflavin resistance protein  26.02 
 
 		 1053 aa  313  9e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  24.72 
 
 		 1121 aa  313  9e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2744  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.21 
 
 		 1067 aa  313  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0890  acriflavin resistance protein  24.73 
 
 		 1053 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  25.46 
 
 		 1039 aa  305  4.0000000000000003e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  24.2 
 
 		 1044 aa  305  4.0000000000000003e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1057  acriflavin resistance protein  25.05 
 
 		 1035 aa  303  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.828249  normal  0.914688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3096  acriflavin resistance protein  23.92 
 
 		 1030 aa  302  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0403  acriflavin resistance protein  25.33 
 
 		 1069 aa  298  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0813  acriflavin resistance protein  24.57 
 
 		 1053 aa  298  5e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3537  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1025 aa  297  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0823297  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0074  acriflavin resistance protein  27.24 
 
 		 1056 aa  296  2e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.247567  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1066  acriflavin resistance protein  25.28 
 
 		 1035 aa  295  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0284295  hitchhiker  0.000200954 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  25.77 
 
 		 1023 aa  291  6e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1975  acriflavin resistance protein  26.06 
 
 		 1062 aa  289  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.240252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1402  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1030 aa  289  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.335441 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000668  RND multidrug efflux transporter  24.14 
 
 		 1050 aa  286  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644957  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4483  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.11 
 
 		 1074 aa  286  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2362  acriflavin resistance protein  25.26 
 
 		 1032 aa  284  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000980319  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1848  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.01 
 
 		 1054 aa  284  6.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06545  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1052 aa  280  8e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1635  acriflavin resistance protein  24.19 
 
 		 1054 aa  279  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.346585 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  24.21 
 
 		 1051 aa  275  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0203  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1057 aa  273  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3677  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 		 1053 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  24.32 
 
 		 1034 aa  271  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3934  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  23 
 
 		 1042 aa  270  8e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2378  acriflavin resistance protein  24 
 
 		 1038 aa  270  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0709  RND family efflux transporter  24.15 
 
 		 1048 aa  269  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0718585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  22.88 
 
 		 1053 aa  267  8.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  23.46 
 
 		 1015 aa  267  8.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  23.81 
 
 		 1029 aa  267  8.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  24.21 
 
 		 1134 aa  267  8.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  25.02 
 
 		 1036 aa  266  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02660  putative multidrug resistance protein, AcrB/AcrD/AcrF family  23.65 
 
 		 1056 aa  266  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3332  acriflavin resistance protein  23.86 
 
 		 1057 aa  265  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.74 
 
 		 1093 aa  264  4.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2447  RND family efflux transporter  24.56 
 
 		 1053 aa  264  6.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0926263  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1993  acriflavin resistance protein  24.83 
 
 		 1025 aa  262  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  24.03 
 
 		 1043 aa  262  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1447  acriflavin resistance protein  24.17 
 
 		 1066 aa  261  5.0000000000000005e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.387723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1009 aa  261  5.0000000000000005e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0170  acriflavin resistance protein  25.48 
 
 		 1068 aa  259  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644504 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  23.77 
 
 		 1060 aa  257  7e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  22.89 
 
 		 1165 aa  256  1.0000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  23.1 
 
 		 1191 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  23.98 
 
 		 1034 aa  254  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  23.43 
 
 		 1060 aa  254  7e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  21.77 
 
 		 1034 aa  253  1e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  24.65 
 
 		 1027 aa  253  1e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.03 
 
 		 1019 aa  252  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1637  acriflavin resistance protein  24.05 
 
 		 1048 aa  252  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000116339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  23.15 
 
 		 1011 aa  253  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  21.81 
 
 		 1044 aa  253  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  23.18 
 
 		 1143 aa  251  6e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  22.98 
 
 		 1034 aa  250  9e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  24.32 
 
 		 1038 aa  250  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1969  acriflavin resistance protein  24.4 
 
 		 1064 aa  250  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00241443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  23 
 
 		 1020 aa  250  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  23.7 
 
 		 1073 aa  250  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  23.96 
 
 		 1039 aa  249  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.42 
 
 		 1032 aa  249  2e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  23.26 
 
 		 1022 aa  248  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  22.99 
 
 		 1040 aa  247  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  26.14 
 
 		 1042 aa  246  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  23.75 
 
 		 1092 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  23.44 
 
 		 1050 aa  247  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>