More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3232 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1029 aa  2076    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  49.4 
 
 		 1009 aa  1001    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  29.29 
 
 		 1020 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  28.54 
 
 		 1028 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1012 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  28.96 
 
 		 1035 aa  439  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  29.18 
 
 		 1020 aa  429  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1014 aa  424  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1023 aa  412  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  27.54 
 
 		 1019 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1024 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.99 
 
 		 1019 aa  405  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  28.44 
 
 		 1043 aa  405  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1035 aa  406  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1035 aa  405  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  28.95 
 
 		 1027 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1019 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  29.1 
 
 		 1025 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  26.88 
 
 		 1025 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1046 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  28.51 
 
 		 1041 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  29.81 
 
 		 1019 aa  394  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  27.86 
 
 		 1035 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1026 aa  392  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  27.4 
 
 		 1025 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1036 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  29.25 
 
 		 1023 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  26.77 
 
 		 1044 aa  389  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  26.77 
 
 		 1045 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  27.82 
 
 		 1025 aa  385  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  28.43 
 
 		 1013 aa  385  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  27.09 
 
 		 1030 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  26.7 
 
 		 1021 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  26.95 
 
 		 1046 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  27 
 
 		 1020 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3129  acriflavin resistance protein  27.89 
 
 		 1021 aa  386  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  27.5 
 
 		 1036 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  27.87 
 
 		 1021 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  28.71 
 
 		 1026 aa  382  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1023 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1008 aa  382  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  26.17 
 
 		 1036 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.21 
 
 		 1010 aa  382  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  28.77 
 
 		 1019 aa  380  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  27.21 
 
 		 1025 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  27.83 
 
 		 1021 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  27.87 
 
 		 1021 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  27.19 
 
 		 1050 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  28.37 
 
 		 1021 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.49 
 
 		 1027 aa  376  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  27.61 
 
 		 1038 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  27.77 
 
 		 1018 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1046 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1020 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  28.33 
 
 		 1016 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 		 1049 aa  372  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  25.9 
 
 		 1039 aa  372  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2689  acriflavin resistance protein  27.71 
 
 		 1026 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3222  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 		 1020 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1049 aa  373  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 		 1039 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  28.39 
 
 		 1016 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  28.71 
 
 		 1025 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  27.1 
 
 		 1048 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.04 
 
 		 1050 aa  371  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 		 1039 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.99 
 
 		 1036 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  27.9 
 
 		 1018 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1025 aa  372  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1047 aa  373  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  28.46 
 
 		 1027 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  27.47 
 
 		 1051 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1051 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  27.14 
 
 		 1028 aa  368  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  26.71 
 
 		 1029 aa  369  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  28.26 
 
 		 1021 aa  368  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.95 
 
 		 1032 aa  369  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  27.13 
 
 		 1019 aa  365  2e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  27.36 
 
 		 1014 aa  365  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  25.7 
 
 		 1046 aa  365  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  26.35 
 
 		 1040 aa  365  3e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3465  RND family efflux transporter MFP subunit  27.48 
 
 		 1017 aa  364  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0968249  normal  0.0910855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1024 aa  364  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1029 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1029 aa  363  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  26.34 
 
 		 1092 aa  363  8e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  28.75 
 
 		 1027 aa  363  1e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  25.37 
 
 		 1036 aa  362  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1029 aa  362  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 		 1034 aa  362  2e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  26.03 
 
 		 1041 aa  362  3e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 		 1047 aa  361  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1029 aa  361  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  28.03 
 
 		 1029 aa  361  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1029 aa  361  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  26.3 
 
 		 1017 aa  360  6e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  25.02 
 
 		 1067 aa  360  6e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  26.14 
 
 		 1022 aa  360  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 		 1011 aa  360  7e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  25.25 
 
 		 1028 aa  360  7e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>