More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2294 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  37.55 
 
 		 1021 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  38.48 
 
 		 1028 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  37.49 
 
 		 1039 aa  681    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  36.32 
 
 		 1045 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  37.71 
 
 		 1025 aa  672    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  38.82 
 
 		 1021 aa  685    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  37.45 
 
 		 1056 aa  660    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  37.67 
 
 		 1039 aa  684    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  38.43 
 
 		 1053 aa  645    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  37.48 
 
 		 1020 aa  655    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  38.48 
 
 		 1028 aa  641    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  37.48 
 
 		 1039 aa  678    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  38.86 
 
 		 1025 aa  666    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  38.67 
 
 		 1036 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  37.87 
 
 		 1022 aa  656    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  40.62 
 
 		 1029 aa  676    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  37.9 
 
 		 1025 aa  657    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  40.39 
 
 		 1010 aa  727    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  36.77 
 
 		 1019 aa  677    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  38.76 
 
 		 1028 aa  674    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  38.01 
 
 		 1028 aa  645    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  36.32 
 
 		 1046 aa  660    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  38.07 
 
 		 1025 aa  658    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  36.99 
 
 		 1060 aa  639    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  36.61 
 
 		 1046 aa  675    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  39.48 
 
 		 1040 aa  722    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  37.66 
 
 		 1019 aa  672    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  41.8 
 
 		 1017 aa  669    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  37.08 
 
 		 1023 aa  661    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  39.19 
 
 		 1036 aa  686    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  36.02 
 
 		 1046 aa  652    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  39.23 
 
 		 1024 aa  653    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  36.68 
 
 		 1044 aa  651    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  37.02 
 
 		 1036 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  39.92 
 
 		 1029 aa  671    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  38.94 
 
 		 1024 aa  683    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1012 aa  1985    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  40.08 
 
 		 1027 aa  652    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.96 
 
 		 1016 aa  679    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  40.44 
 
 		 1029 aa  666    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  40.44 
 
 		 1029 aa  666    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  39.46 
 
 		 1036 aa  682    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  38.8 
 
 		 1013 aa  677    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2179  acriflavin resistance protein  36.81 
 
 		 1051 aa  645    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.381595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  42.39 
 
 		 1013 aa  706    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  38.06 
 
 		 1031 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  39.29 
 
 		 1021 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  39.92 
 
 		 1029 aa  671    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  37.6 
 
 		 1021 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  36.98 
 
 		 1041 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  37.88 
 
 		 1025 aa  657    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  38.48 
 
 		 1028 aa  640    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  41.01 
 
 		 1032 aa  693    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  39.12 
 
 		 1025 aa  695    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  39.98 
 
 		 1027 aa  660    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  38.35 
 
 		 1009 aa  703    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  39.82 
 
 		 1029 aa  666    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  38.33 
 
 		 1028 aa  683    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  37.78 
 
 		 1021 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  38.35 
 
 		 1019 aa  681    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  36.63 
 
 		 1067 aa  632  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  36.82 
 
 		 1014 aa  634  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1047  acriflavin resistance protein  37.25 
 
 		 1021 aa  633  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0882711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  36.91 
 
 		 1021 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3465  RND family efflux transporter MFP subunit  38.22 
 
 		 1017 aa  633  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0968249  normal  0.0910855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3505  acriflavin resistance protein  37.39 
 
 		 1029 aa  635  1e-180  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.348993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  36.09 
 
 		 1050 aa  635  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.26 
 
 		 1019 aa  630  1e-179  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  36.51 
 
 		 1022 aa  632  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  36.21 
 
 		 1015 aa  632  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2796  acriflavin resistance protein  36.79 
 
 		 1059 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.963935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1556  acriflavin resistance protein  36.65 
 
 		 1056 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  35.68 
 
 		 1048 aa  632  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  35.24 
 
 		 1046 aa  632  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  37.05 
 
 		 1024 aa  631  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  36.12 
 
 		 1047 aa  628  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  35.38 
 
 		 1047 aa  627  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1021 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  38.55 
 
 		 1016 aa  623  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  38.28 
 
 		 1014 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  36.96 
 
 		 1049 aa  621  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  34.65 
 
 		 1027 aa  622  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3339  acriflavin resistance protein  36.24 
 
 		 1053 aa  622  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  35.57 
 
 		 1019 aa  620  1e-176  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  37.59 
 
 		 1016 aa  621  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  37.12 
 
 		 1041 aa  620  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  38.49 
 
 		 1014 aa  619  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  36.26 
 
 		 1017 aa  617  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3222  acriflavin resistance protein  37.75 
 
 		 1020 aa  618  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  36.44 
 
 		 1020 aa  619  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  35.28 
 
 		 1017 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  35.18 
 
 		 1017 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  36.77 
 
 		 1049 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  35.04 
 
 		 1018 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  37.01 
 
 		 1019 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  36.89 
 
 		 1041 aa  612  1e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  35.44 
 
 		 1016 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  37.55 
 
 		 1041 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1020 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  35.4 
 
 		 1067 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>