More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000655 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  36.29 
 
 		 1019 aa  667    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.86 
 
 		 1016 aa  662    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  35.79 
 
 		 1056 aa  650    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.97 
 
 		 1028 aa  655    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  70.41 
 
 		 1027 aa  1469    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  37.48 
 
 		 1012 aa  640    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  37.6 
 
 		 1010 aa  691    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  35.93 
 
 		 1019 aa  665    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  36.96 
 
 		 1032 aa  652    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  36.86 
 
 		 1013 aa  646    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  36.29 
 
 		 1025 aa  660    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  100 
 
 		 1020 aa  2068    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  35.65 
 
 		 1023 aa  646    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  35.87 
 
 		 1019 aa  665    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  37.41 
 
 		 1036 aa  676    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  37.16 
 
 		 1036 aa  671    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  62.54 
 
 		 1035 aa  1297    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  62.54 
 
 		 1035 aa  1296    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  41.61 
 
 		 1013 aa  808    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  35.85 
 
 		 1021 aa  657    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  35.86 
 
 		 1009 aa  661    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  63.5 
 
 		 1035 aa  1290    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  34.2 
 
 		 1040 aa  630  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  38.34 
 
 		 1029 aa  631  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  38.34 
 
 		 1029 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  37.21 
 
 		 1025 aa  626  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  37.46 
 
 		 1024 aa  626  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  36.69 
 
 		 1016 aa  628  1e-178  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  38.21 
 
 		 1027 aa  624  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  35.36 
 
 		 1025 aa  625  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  35.32 
 
 		 1024 aa  623  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  36.86 
 
 		 1028 aa  622  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  37.49 
 
 		 1029 aa  619  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  37.39 
 
 		 1029 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  37.39 
 
 		 1029 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  37.65 
 
 		 1027 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  37.2 
 
 		 1029 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  35.94 
 
 		 1021 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.53 
 
 		 1014 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  35 
 
 		 1017 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  34.98 
 
 		 1041 aa  601  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  34.45 
 
 		 1014 aa  598  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  34.32 
 
 		 1015 aa  593  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  35.12 
 
 		 1029 aa  589  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  36.38 
 
 		 1028 aa  589  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  36.22 
 
 		 1017 aa  587  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1019 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  34.36 
 
 		 1020 aa  572  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  32.61 
 
 		 1022 aa  567  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.22 
 
 		 1013 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5191  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.24 
 
 		 1033 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  33.62 
 
 		 1043 aa  562  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.32 
 
 		 1028 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  35.32 
 
 		 1028 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  35.22 
 
 		 1028 aa  554  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0346  acriflavin resistance protein  32.23 
 
 		 1033 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463881  normal  0.463226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 		 1073 aa  552  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  34.06 
 
 		 1053 aa  552  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  31.86 
 
 		 1044 aa  550  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  31.99 
 
 		 1016 aa  552  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0232  acriflavin resistance protein  32.71 
 
 		 1017 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  31.44 
 
 		 1050 aa  543  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  32.65 
 
 		 1025 aa  545  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  31.77 
 
 		 1041 aa  543  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  31.87 
 
 		 1067 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1101  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 		 1044 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.312042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  31.77 
 
 		 1018 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  31.66 
 
 		 1036 aa  538  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5080  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1017 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.373906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  31.35 
 
 		 1031 aa  538  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2039  RND family mulitdrug efflux protein  31.3 
 
 		 1025 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1308  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.67 
 
 		 1036 aa  535  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5173  acriflavin resistance protein  31.67 
 
 		 1017 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.181965  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2815  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.07 
 
 		 1017 aa  534  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0518432  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  32.65 
 
 		 1014 aa  535  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  32.96 
 
 		 1016 aa  536  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  31.4 
 
 		 1018 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5233  acriflavin resistance protein  31.38 
 
 		 1020 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  32.65 
 
 		 1024 aa  533  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4708  acriflavin resistance protein  31.8 
 
 		 1020 aa  530  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.556784 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  31.6 
 
 		 1039 aa  532  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0914  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  30.91 
 
 		 1024 aa  531  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  32.13 
 
 		 1040 aa  531  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2780  acriflavin resistance protein  32.24 
 
 		 1021 aa  531  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.51782 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  32.84 
 
 		 1025 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4339  acriflavin resistance protein  31.95 
 
 		 1020 aa  531  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  31.86 
 
 		 1046 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0289  acriflavin resistance protein  31.56 
 
 		 1021 aa  532  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.461457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  32.62 
 
 		 1025 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  31.05 
 
 		 1039 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0857  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  30.91 
 
 		 1024 aa  529  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634925  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3132  acriflavin resistance protein  32.05 
 
 		 1012 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1049 aa  527  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 		 1022 aa  528  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3465  RND family efflux transporter MFP subunit  31.71 
 
 		 1017 aa  529  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0968249  normal  0.0910855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0734  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 		 1035 aa  529  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  30.49 
 
 		 1047 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 		 1023 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  30.8 
 
 		 1036 aa  528  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2293  acriflavin resistance protein  31.71 
 
 		 1042 aa  523  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497633  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>